Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02765
- Subject:
- XR_001751184.1
- Aligned Length:
- 4292
- Identities:
- 3287
- Gaps:
- 1005
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAAAAACAGGAAGTGCCTACGGAGGCCGGGCCGGCAGCGGCGGCCGGGCATGAAGCCGGGCGGCTACGGGATCG 74
Query 1 ---------------------------------ATGAGCGACATAGTGGAGAAGACGCTGACGGCGCTGCCGGG 41
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGGCGGCGGCGGCATCGCGGGCGGCGGCGGCGATGAGCGACATAGTGGAGAAGACGCTGACGGCGCTGCCGGG 148
Query 42 ACTCTTTCTGCAGAACCAGCCCGGTGGTGGGCCCGCGGCCGCCAAGGCGTCCTTCTCCTCGAGGCTGGGCAGCC 115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACTCTTTCTGCAGAACCAGCCCGGTGGTGGGCCCGCGGCCGCCAAGGCGTCCTTCTCCTCGAGGCTGGGCAGCC 222
Query 116 TTGTCCGCGGCATCACAGCCCTCACCTCCAAGCACGAAGAAGAAAAATTAATCCAGCAGGAACTGAGTAGTCTG 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGTCCGCGGCATCACAGCCCTCACCTCCAAGCACGAAGAAGAAAAATTAATCCAGCAGGAACTGAGTAGTCTG 296
Query 190 AAAGCGACTGTTTCTGCTCCTACTACAACACTGAAAATGATGAAGGAATGTATGGTGAGACTTATATATTGTGA 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAGCGACTGTTTCTGCTCCTACTACAACACTGAAAATGATGAAGGAATGTATGGTGAGACTTATATATTGTGA 370
Query 264 AATGCTTGGATATGATGCTTCCTTTGGCTATATTCATGCAATCAAGTTAGCCCAACAAGGAAACCTCTTAGAAA 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATGCTTGGATATGATGCTTCCTTTGGCTATATTCATGCAATCAAGTTAGCCCAACAAGGAAACCTCTTAGAAA 444
Query 338 AAAGAGTAGGTTATTTGGCTGTTTCCTTATTTCTACATGAAAGTCATGAATTATTGCTTCTCCTTGTGAATACA 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGAGTAGGTTATTTGGCTGTTTCCTTATTTCTACATGAAAGTCATGAATTATTGCTTCTCCTTGTGAATACA 518
Query 412 GTTGTAAAGGATCTGCAGAGCACTAACCTAGTAGAAGTGTGTATGGCACTGACTGTTGTTAGCCAGATTTTCCC 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTGTAAAGGATCTGCAGAGCACTAACCTAGTAGAAGTGTGTATGGCACTGACTGTTGTTAGCCAGATTTTCCC 592
Query 486 CTGCGAAATGATTCCAGCTGTTCTTCCATTAATAGAAGATAAACTTCAACATTCTAAGGAGATTGTACGAAGAA 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGCGAAATGATTCCAGCTGTTCTTCCATTAATAGAAGATAAACTTCAACATTCTAAGGAGATTGTACGAAGAA 666
Query 560 AAGCTGTTCTGGCATTATACAAATTCCATCTCATTGCTCCTAATCAAGTACAACATATTCATATTAAGTTTCGG 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGCTGTTCTGGCATTATACAAATTCCATCTCATTGCTCCTAATCAAGTACAACATATTCATATTAAGTTTCGG 740
Query 634 AAAGCACTTTGTGACAGAGATGTTGGGGTCATGGCTGCCTCCTTGCATATATATCTTAGAATGATTAAGGAGAA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAAGCACTTTGTGACAGAGATGTTGGGGTCATGGCTGCCTCCTTGCATATATATCTTAGAATGATTAAGGAGAA 814
Query 708 TTCATCTGGATATAAAGACTTGACTGGGAGTTTTGTAACCATTTTGAAGCAAGTAGTTGGAGGAAAGCTCCCAG 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCATCTGGATATAAAGACTTGACTGGGAGTTTTGTAACCATTTTGAAGCAAGTAGTTGGAGGAAAGCTCCCAG 888
Query 782 TAGAATTCAATTACCACAGTGTGCCAGCACCATGGTTACAAATTCAGCTCTTGAGAATACTGGGACTTCTAGGA 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TAGAATTCAATTACCACAGTGTGCCAGCACCATGGTTACAAATTCAGCTCTTGAGAATACTGGGACTTCTAGGA 962
Query 856 AAAGATGATCAAAGGACAAGTGAATTAATGTATGATGTTCTTGATGAATCCTTACGAAGAGCTGAGTTAAATCA 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAAGATGATCAAAGGACAAGTGAATTAATGTATGATGTTCTTGATGAATCCTTACGAAGAGCTGAGTTAAATCA 1036
Query 930 CAATGTCACATATGCTATTTTGTTTGAATGTGTGCATACAGTCTATTCTATTTATCCTAAATCGGAATTACTTG 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAATGTCACATATGCTATTTTGTTTGAATGTGTGCATACAGTCTATTCTATTTATCCTAAATCGGAATTACTTG 1110
Query 1004 AGAAGGCTGCCAAGTGCATTGGAAAATTTGTTCTGTCACCTAAAATAAATCTAAAATATTTAGGACTGAAGGCT 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGAAGGCTGCCAAGTGCATTGGAAAATTTGTTCTGTCACCTAAAATAAATCTAAAATATTTAGGACTGAAGGCT 1184
Query 1078 CTTACCTATGTTATCCAACAGGATCCTACTCTGGCTCTTCAACACCAGATGACAATAATTGAATGTTTAGATCA 1151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTACCTATGTTATCCAACAGGATCCTACTCTGGCTCTTCAACACCAGATGACAATAATTGAATGTTTAGATCA 1258
Query 1152 TCCTGATCCCATTATTAAAAGAGAGACTCTGGAACTTCTTTACAGAATTACTAATGCACAGAATATAACAGTTA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCTGATCCCATTATTAAAAGAGAGACTCTGGAACTTCTTTACAGAATTACTAATGCACAGAATATAACAGTTA 1332
Query 1226 TTGTCCAGAAAATGCTTGAATATTTACATCAGAGCAAAGAAGAGTATGTCATCGTCAATTTGGTCGGCAAAATA 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTGTCCAGAAAATGCTTGAATATTTACATCAGAGCAAAGAAGAGTATGTCATCGTCAATTTGGTCGGCAAAATA 1406
Query 1300 GCAGAGCTGGCTGAGAAATATGCTCCTGATAATGCATGGTTTATTCAGACAATGAATGCTGTGTTTTCAGTAGG 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCAGAGCTGGCTGAGAAATATGCTCCTGATAATGCATGGTTTATTCAGACAATGAATGCTGTGTTTTCAGTAGG 1480
Query 1374 AGGAGATGTAATGCATCCTGATATTCCCAATAACTTTCTGAGACTACTAGCGGAAGGTTTTGATGATGAAACAG 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGAGATGTAATGCATCCTGATATTCCCAATAACTTTCTGAGACTACTAGCGGAAGGTTTTGATGATGAAACAG 1554
Query 1448 AAGATCAGCAATTAAGACTCTATGCAGTTCAGTCTTATCTCACTTTACTGGATATGGAAAATGTGTTCTATCCA 1521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGATCAGCAATTAAGACTCTATGCAGTTCAGTCTTATCTCACTTTACTGGATATGGAAAATGTGTTCTATCCA 1628
Query 1522 CAGAGATTTCTTCAAGTTATGAGTTGGGTATTAGGGGAATATTCCTACCTCTTAGATAAGGAAACGCCAGAGGA 1595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGAGATTTCTTCAAGTTATGAGTTGGGTATTAGGGGAATATTCCTACCTCTTAGATAAGGAAACGCCAGAGGA 1702
Query 1596 AGTTATAGCTAAGCTCTACAAGTTACTTATGAATGACTCTGTGTCTTCAGAAACAAAAGCCTGGTTAATTGCTG 1669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGTTATAGCTAAGCTCTACAAGTTACTTATGAATGACTCTGTGTCTTCAGAAACAAAAGCCTGGTTAATTGCTG 1776
Query 1670 CTGTGACCAAATTGACATCTCAGGCGCACTCTTCTAATACAGTTGAGAGATTAATCCATGAATTTACCATATCT 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGTGACCAAATTGACATCTCAGGCGCACTCTTCTAATACAGTTGAGAGATTAATCCATGAATTTACCATATCT 1850
Query 1744 TTGGATACTTGTATGAGACAACATGCATTTGAATTAAAACATTTGCATGAGAATGTGGAACTTATGAAGAGCTT 1817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTGGATACTTGTATGAGACAACATGCATTTGAATTAAAACATTTGCATGAGAATGTGGAACTTATGAAGAGCTT 1924
Query 1818 GCTTCCAGTTGACAGGAGTTGTGAAGACTTGGTGGTAGATGCTTCTTTATCTTTTCTGGATGGTTTTGTGGCTG 1891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCTTCCAGTTGACAGGAGTTGTGAAGACTTGGTGGTAGATGCTTCTTTATCTTTTCTGGATGGTTTTGTGGCTG 1998
Query 1892 AAGGACTCAGTCAGGGTGCAGCGCCTTACAAACCTCCCCATCAACGCCAGGAGGAAAAGCTTTCTCAGGAAAAA 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGGACTCAGTCAGGGTGCAGCGCCTTACAAACCTCCCCATCAACGCCAGGAGGAAAAGCTTTCTCAGGAAAAA 2072
Query 1966 GTTCTCAATTTTGAACCATATGGACTCTCCTTTTCTTCATCTGGCTTCACTGGACGACAGTCTCCTGCTGGCAT 2039
|
Sbjct 2073 G------------------------------------------------------------------------- 2073
Query 2040 TTCTCTTGGTTCAGATGTATCTGGGAATAGTGCTGAGACAGGACTGAAAGAGACAAATAGCTTGAAGCTGGAAG 2113
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 ---------------------------------------------------GACAAATAGCTTGAAGCTGGAAG 2096
Query 2114 GTATAAAGAAATTGTGGGGGAAAGAAGGCTATCTTCCCAAGAAGGAAAGCAAAACTGGTGATGAAAGTGGAGCT 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 GTATAAAGAAATTGTGGGGGAAAGAAGGCTATCTTCCCAAGAAGGAAAGCAAAACTGGTGATGAAAGTGGAGCT 2170
Query 2188 CTGCCTGTTCCTCAAGAGAGTATAATGGAGAATGTAGATCAAGCTATAACTAAAAAGGATCAATCTCAAGTTCT 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2171 CTGCCTGTTCCTCAAGAGAGTATAATGGAGAATGTAGATCAAGCTATAACTAAAAAGGATCAATCTCAAGTTCT 2244
Query 2262 TACCCAATCTAAAGAGGAGAAAGAAAAGCAGCTGCTGGCATCATCATTATTTGTTGGTCTAGGATCAGAAAGTA 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 TACCCAATCTAAAGAGGAGAAAGAAAAGCAGCTGCTGGCATCATCATTATTTGTTGGTCTAGGATCAGAAAGTA 2318
Query 2336 CAATCAACCTGCTGGGAAAAGCAGATACTGTCTCTCACAAGTTCAGAAGGAAATCAAAAGTCAAAGAAGCTAAA 2409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 CAATCAACCTGCTGGGAAAAGCAGATACTGTCTCTCACAAGTTCAGAAGGAAATCAAAAGTCAAAGAAGCTAAA 2392
Query 2410 AGTGGCGAAACAACCAGTACTCATAATATGACCTGTTCTTCCTTTAGTTCTTTGTCAAATGTGGCATATGAAGA 2483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 AGTGGCGAAACAACCAGTACTCATAATATGACCTGTTCTTCCTTTAGTTCTTTGTCAAATGTGGCATATGAAGA 2466
Query 2484 TGATTATTATTCGAATACTTTGCACGATACAGGAGACAAGGAATTAAAGAAATTTTCTCTCACTTCAGAACTTT 2557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2467 TGATTATTATTCGAATACTTTGCACGATACAGGAGACAAGGAATTAAAGAAATTTTCTCTCACTTCAGAACTTT 2540
Query 2558 TGGATTCTGAGTCACTCACAGAACTGCCCTTGGTTGAGAAATTCTCATATTGTAGTCTGTCTACACCTTCATTG 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 TGGATTCTGAGTCACTCACAGAACTGCCCTTGGTTGAGAAATTCTCATATTGTAGTCTGTCTACACCTTCATTG 2614
Query 2632 TTTGCTAATAACAACATGGAAATTTTTCACCCTCCTCAATCTACTGCAGCCTCAGTTGCCAAGGAAAGCTCTTT 2705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2615 TTTGCTAATAACAACATGGAAATTTTTCACCCTCCTCAATCTACTGCAGCCTCAGTTGCCAAGGAAAGCTCTTT 2688
Query 2706 AGCTTCATCTTTTTTGGAAGAAACTACTGAATACATACACTCAAATGCTATGGAAGTCTGTAATAATGAAACTA 2779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2689 AGCTTCATCTTTTTTGGAAGAAACTACTGAATACATACACTCAAATGCTATGGAAGTCTGTAATAATGAAACTA 2762
Query 2780 TATCAGTGTCTTCTTATAAAATTTGGAAAGATGATTGTTTATTGATGGTCTGGTCAGTCACTAATAAGAGTGGT 2853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2763 TATCAGTGTCTTCTTATAAAATTTGGAAAGATGATTGTTTATTGATGGTCTGGTCAGTCACTAATAAGAGTGGT 2836
Query 2854 TTGGAATTGAAAAGTGCTGACTTAGAAATTTTTCCTGCAGAAAATTTCAAGGTGACTGAGCAACCTGGATGCTG 2927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2837 TTGGAATTGAAAAGTGCTGACTTAGAAATTTTTCCTGCAGAAAATTTCAAGGTGACTGAGCAACCTGGATGCTG 2910
Query 2928 TTTGCCTGTAATGGAAGCAGAAAGCACCAAAAGCTTTCAATATAGTGTGCAGATAGAAAAACCTTTTACAGAAG 3001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2911 TTTGCCTGTAATGGAAGCAGAAAGCACCAAAAGCTTTCAATATAGTGTGCAGATAGAAAAACCTTTTACAGAAG 2984
Query 3002 GAAATCTTACTGGTTTTATTAGTTATCATATGATGGATACTCATTCTGCTCAGCTGGAATTTTCTGTAAACTTA 3075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 GAAATCTTACTGGTTTTATTAGTTATCATATGATGGATACTCATTCTGCTCAGCTGGAATTTTCTGTAAACTTA 3058
Query 3076 TCACTATTAGATTTCATTAGACCATTAAAAATCTCAAGTGACGACTTTGGGAAACTCTGGTTATCCTTCGCAAA 3149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 TCACTATTAGATTTCATTAGACCATTAAAAATCTCAAGTGACGACTTTGGGAAACTCTGGTTATCCTTCGCAAA 3132
Query 3150 TGATGTGAAACAAAATGTAAAAATGTCAGAATCTCAAGCTGCACTTCCTTCTGCACTAAAGACTCTGCAACAGA 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 TGATGTGAAACAAAATGTAAAAATGTCAGAATCTCAAGCTGCACTTCCTTCTGCACTAAAGACTCTGCAACAGA 3206
Query 3224 AACTAAGACTCCATATTATTGAGATTATAGGCAATGAAGGGCTATTGGCCTGTCAGCTGCTCCCATCCATCCCC 3297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3207 AACTAAGACTCCATATTATTGAGATTATAGGCAATGAAGGGCTATTGGCCTGTCAGCTGCTCCCATCCATCCCC 3280
Query 3298 TGCTTACTGCATTGCCGAGTTCATGCAGATGTATTAGCCCTGTGGTTCAGATCCTCCTGTTCTACTCTTCCTGA 3371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3281 TGCTTACTGCATTGCCGAGTTCATGCAGATGTATTAGCCCTGTGGTTCAGATCCTCCTGTTCTACTCTTCCTGA 3354
Query 3372 CTATTTACTGTATCAGTGTCAAAAGGTGATGGAGGGATCC---------------------------------- 3411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 CTATTTACTGTATCAGTGTCAAAAGGTGATGGAGGGATCCTAGCAGAAGCCCTGCTAAATTTTACTCCATCAAG 3428
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3429 ATCAATGGTTTACATAGATAAACTTATTTACCAAAGTAAAAAGAACTCATGGTACTTCTAATGAAAATGGGGAT 3502
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3503 TATTACAAGTGTGGTTTATATGTTTTCTTTGTGATTCCTGGTCAAGAAAGATCCCCAAAACTGTATCCCTAACC 3576
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3577 TTTAACTCAGGATTGTACAGTATGTTTAGGTCCCTCAAAAAGTGACCTAAGCTAATGTTATAAACTGCTAATGA 3650
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3651 TTTATATATCACTTAGTGTGTAGAGGGACTGAAAATATTTATTTTGTTATAAATAATTTTATAGCACGTTTACT 3724
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3725 CTAGTGCTAGCTAATTTGTAATAAAGCCAAGTCTCAGTTTTCTGCATTAAATGGAAGGGAGACATGAAATTGAT 3798
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3799 AATCTCAAACTTAATTCATATTTGGCTTTGGAATGTAGTGTATGGTTTTTGGTAGGGAAGTCAATATTTTCGAT 3872
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3873 TATGTTTTGCTTAGATCAGTGTTGAACTAAGTTGGCATAGCACACACTAACAGTTGTAGGAGATCCATGAGCAT 3946
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 3947 GCTGGATATTGAGGGGATCCAATCTGTGATCTATTTTTTATTATAGATAACTGTTACACATAATTTCAGATCGT 4020
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 4021 TTGGCTGTAAAATTTGTCTGTTTTCCACTTGGAGTTATTTTAAAATTCAAAGTAAATCACTCTATTCTTATTTT 4094
Query 3412 -------------------------------------------------------------------------- 3411
Sbjct 4095 GAAAACTCAGAGCCATTTTATATAGAAACAAAACCCATAAGAGCACACAGTAACAAAGCAAACAGATACAAAAA 4168