Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: NM_001110827.2
• Aligned Length: 1352
• Identities: 1050
• Gaps: 229

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA--  15
                                                                     |||||.....||.||  
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG  222

Query   16  -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT  88
             ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT  292

Query   89  TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC  162
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC  366

Query  163  GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC  235
            .||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  367  AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC  439

Query  236  AAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA  306
            |.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA  513

Query  307  AATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCT  380
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  514  AATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCT  587

Query  381  CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGAT  454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  588  CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGAT  661

Query  455  TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAG  528
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  662  TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAG  735

Query  529  GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAA  602
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  736  GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAA  809

Query  603  TGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAG  676
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  810  TGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTG  883

Query  677  ATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATC  750
            |||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  884  ATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATC  957

Query  751  AGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTT  824
            |            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.|
Sbjct  958  A------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCT  1019

Query  825  GAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTG  898
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020  GAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTG  1093

Query  899  TGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCT  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  TGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCT  1167

Query  973  ACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGC  1046
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1168  ACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGC  1241

Query 1047  CGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCT  1120
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1242  TGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCT  1315

Query 1121  ACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1140
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1316  ACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1335