Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02790
- Subject:
- NM_001286418.1
- Aligned Length:
- 1141
- Identities:
- 796
- Gaps:
- 293
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
Query 75 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 148
||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT 148
Query 149 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA 221
||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 149 ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA 221
Query 222 CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACAC 295
.||||||||||..||.|||||||||||.||
Sbjct 222 TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCAC-------------------------------------------- 251
Query 296 AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGG 369
Sbjct 252 -------------------------------------------------------------------------- 251
Query 370 GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGG 443
Sbjct 252 -------------------------------------------------------------------------- 251
Query 444 CTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCA 517
Sbjct 252 -------------------------------------------------------------------------- 251
Query 518 CCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACA 591
||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 252 -------------------------GGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACG 300
Query 592 CCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAG 665
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAG 374
Query 666 CTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACA 739
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 375 CTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACA 448
Query 740 TTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGA 813
|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 449 TCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGA 522
Query 814 GGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC 887
|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 GGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC 596
Query 888 CTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATG 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 CTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATG 670
Query 962 CACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGG 1035
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 671 CACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGG 744
Query 1036 GTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATA 1109
|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 745 GTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTA 818
Query 1110 CCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 CCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 849