Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: NM_001349994.2
• Aligned Length: 1218
• Identities: 1080
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  -----------------------------------ATG-GAGAAAAAG----------------AAAATGGTAA  22
                                               .|| |||||..||                |..||||  |
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGTGAGAACGAGCCTCTGACTCCAGGTTATCATGG--A  72

Query   23  CT----------------CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTAC  80
            .|                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TTCCCAGCGCGGGACAGCCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTAC  146

Query   81  CATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCG  220

Query  155  GCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCC  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  GCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCC  294

Query  229  AGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAG  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAG  368

Query  303  TGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTG  442

Query  377  ACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAG  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  ACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAG  516

Query  451  GGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGT  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGT  590

Query  525  AGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATG  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  AGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATG  664

Query  599  CAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAA  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  CAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAA  738

Query  673  GCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTT  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTT  812

Query  747  AATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCC  820
            |||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCC  874

Query  821  ATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCA  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  ATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCA  948

Query  895  GGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCC  968
            ||                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  GG----------------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCC  982

Query  969  TGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACA  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  TGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACA  1056

Query 1043  CAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGT  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  CAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGT  1130

Query 1117  GGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC----------  1140
            ||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1131  GGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG  1164