Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: NM_001349999.1
• Aligned Length: 1355
• Identities: 1120
• Gaps: 229

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAGGGCGCCCAGCCGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCCGCCGCCCGGGGCATGAAGCGGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTCGGAGCTGGAGCTGCCGGTGCCCGGAGCGGGAGGAGACGGAGCCGATCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCGCGCA  148

Query    1  --------------------------------ATGGAGAAAAAG----------------AAAATGGTAACT--  24
                                            |||.||||..||                |..||||  |.|  
Sbjct  149  CTGAGGAGGCGGCGGCCGACGGTGGCGGCGGGATGCAGAACGAGCCTCTGACTCCAGGTTATCATGG--ATTCC  220

Query   25  --------------CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATC  84
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  CAGCGCGGGACAGCCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATC  294

Query   85  CCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCA  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  CCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCA  368

Query  159  GACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCA  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  GACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCA  442

Query  233  CACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGT  303
            |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGT  516

Query  304  GAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGA  377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGA  590

Query  378  CCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGG  451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  CCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGG  664

Query  452  GATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTA  525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  GATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTA  738

Query  526  GAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGC  599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGC  812

Query  600  AAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAG  673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAG  886

Query  674  CAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTA  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTA  960

Query  748  ATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCA  821
            ||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCA  1022

Query  822  TTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAG  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  TTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAG  1096

Query  896  GTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCT  969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  GTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCT  1170

Query  970  GCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACAC  1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  GCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACAC  1244

Query 1044  AGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTG  1117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  AGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTG  1318

Query 1118  GCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1140
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  GCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1341