Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02790
- Subject:
- XM_005261430.2
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1106
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAGGGCGCCCAGCCGCATCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCCGCCGCCCGGGGCATGAAGCGGGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCGGAGCTGGAGCTGCCGGTGCCCGGAGCGGGAGGAGACGGAGCCGATCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCGCGCA 148
Query 1 --------------------------------ATGGAGAAAAAG----------------AAAATGGTAACT-- 24
|||.||||..|| |..|||| |.|
Sbjct 149 CTGAGGAGGCGGCGGCCGACGGTGGCGGCGGGATGCAGAACGAGCCTCTGACTCCAGGTTATCATGG--ATTCC 220
Query 25 --------------CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATC 84
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 CAGCGCGGGACAGCCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATC 294
Query 85 CCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCA 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCA 368
Query 159 GACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCA 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCA 442
Query 233 CACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGT 303
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 CACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGT 516
Query 304 GAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGA 377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGA 590
Query 378 CCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGG 451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 CCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGG 664
Query 452 GATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTA 525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 GATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTA 738
Query 526 GAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGC 812
Query 600 AAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAG 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 AAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAG 886
Query 674 CAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTA 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTA 960
Query 748 ATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCA 821
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCA 1022
Query 822 TTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAG 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAG 1096
Query 896 GTGTGGT-TTACCAGGACGGATT--TTACGGTGCT----GACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGC 962
|..|.|| ||| |||||...|.| ||| |.||| .||||| |.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 GAATAGTCTTA-CAGGAACCAATCATTA--GCGCTAAAATACCTC-AGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGC 1166
Query 963 ACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 ACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGG 1240
Query 1037 TGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 TGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATAC 1314
Query 1111 CGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 CGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1344