Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006521570.2
• Aligned Length: 1391
• Identities: 1050
• Gaps: 268

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA--  15
                                                                     |||||.....||.||  
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG  222

Query   16  -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT  88
             ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT  292

Query   89  TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC  162
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC  366

Query  163  GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC  235
            .||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  367  AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC  439

Query  236  AAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  309
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  513

Query  310  TCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCG  383
            |||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  514  TCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCG  587

Query  384  GCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCG  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  588  GCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCG  661

Query  458  GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGC  735

Query  532  CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGG  605
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  736  CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGG  809

Query  606  TTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATG  679
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  810  CTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATG  883

Query  680  TGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGT  753
            ||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||  
Sbjct  884  TGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCA--  955

Query  754  CTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAG  827
                      |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  956  ----------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAG  1019

Query  828  GGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGG  901
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020  GGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGG  1093

Query  902  TTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT--------------------------------GGTGGAT  943
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                |||||||
Sbjct 1094  TTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAATCTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGGGTGGAT  1167

Query  944  ATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTAC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168  ATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTAC  1241

Query 1018  AGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGG  1091
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1242  AGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGG  1315

Query 1092  CGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC----------  1140
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1316  CGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG  1374