Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006521578.3
• Aligned Length: 1361
• Identities: 1001
• Gaps: 256

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGGAGA  7
                                                                               |||||..
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGCGAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATT  74

Query    8  AAAAGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  78
            ...||.||   ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  144

Query   79  ACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGC  152
            ||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  145  ACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGC  218

Query  153  CGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCA  225
            ||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  219  CGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCA  291

Query  226  CCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACA  296
            |||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  292  CCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACA  365

Query  297  AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  366  AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAG  439

Query  371  ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  440  ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGC  513

Query  445  TCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCAC  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  TCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCAC  587

Query  519  CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  588  CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGC  661

Query  593  CATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGC  666
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  662  CATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGC  735

Query  667  TTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACAT  740
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  736  TTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACAT  809

Query  741  TCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAG  814
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  810  CCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAG  883

Query  815  GAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCC  888
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCC  957

Query  889  TATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------CA  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||         ||
Sbjct  958  TATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCA  1031

Query  949  GCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC-------------  977
            ..|||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||             
Sbjct 1032  CTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTAT  1103

Query  978  -AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC-----------------  1017
             ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||                 
Sbjct 1104  TAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGG  1163

Query 1018  -AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTGC  1067
             ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.|||.
Sbjct 1164  GAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGT  1237

Query 1068  CCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG----------  1124
            ..|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||          
Sbjct 1238  GGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAA  1300

Query 1125  -CCGATTTGCCCCCTAC------------  1140
             |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1301  ACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1326