Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006521584.3
• Aligned Length: 1288
• Identities: 1012
• Gaps: 179

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  148

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  149  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  221

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACAC  295
            .||||||||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  222  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACAC  295

Query  296  AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGG  369
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  296  AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGA  369

Query  370  GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  370  GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGG  443

Query  444  CTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCA  517
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  444  CTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCA  517

Query  518  CCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACA  591
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  518  CCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACG  591

Query  592  CCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAG  665
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAG  665

Query  666  CTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACA  739
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  666  CTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACA  739

Query  740  TTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGA  813
            |.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct  740  TCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGA  813

Query  814  GGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC  887
            |||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC  887

Query  888  CTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------C  947
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||         |
Sbjct  888  CTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTC  961

Query  948  AGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC------------  977
            |..|||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||            
Sbjct  962  ACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTA  1033

Query  978  --AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC----------------  1017
              ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||                
Sbjct 1034  TTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGG  1093

Query 1018  --AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTG  1066
              ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.|||
Sbjct 1094  GGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTG  1167

Query 1067  CCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG---------  1124
            ...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||         
Sbjct 1168  TGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCA  1230

Query 1125  --CCGATTTGCCCCCTAC------------  1140
              |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1231  AACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1257