Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006521585.3
• Aligned Length: 1294
• Identities: 995
• Gaps: 200

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATG--GTAACTC-AGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCC  71
                           |||  |||.||| .|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------ATGATGTACCTCTGGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCC  59

Query   72  TTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAG  145
            |||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct   60  TTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGG  133

Query  146  ACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAG  218
            |||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.||
Sbjct  134  ACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAG  206

Query  219  CAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCAC  289
            |||.||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  207  CAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCAC  280

Query  290  AGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGC  363
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  281  AGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGC  354

Query  364  TTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGA  437
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  355  TTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGA  428

Query  438  ACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTAC  511
            .||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  429  GCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGC  502

Query  512  ACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATG  585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  503  ACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATG  576

Query  586  GTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGC  659
            |||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  577  GTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGC  650

Query  660  ATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACA  733
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  651  ATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACA  724

Query  734  CTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCT  807
            |||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  725  CTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCT  798

Query  808  TTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCAT  881
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  TTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCAT  872

Query  882  CCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG----  946
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||    
Sbjct  873  CCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAA  946

Query  947  -----CAGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC------  977
                 ||..|||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||      
Sbjct  947  CATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTA  1018

Query  978  --------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC----------  1017
                    ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||          
Sbjct 1019  TAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTG  1078

Query 1018  --------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATG  1060
                    ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|
Sbjct 1079  GGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGG  1152

Query 1061  CCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG---  1124
            .|.|||...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||   
Sbjct 1153  TCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCT  1215

Query 1125  --------CCGATTTGCCCCCTAC------------  1140
                    |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1216  AGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1248