Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006521588.3
• Aligned Length: 1291
• Identities: 953
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------ATGGTTCAGCCTTT  14

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   15  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  88

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct   89  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  161

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA  292
            .||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  162  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA  235

Query  293  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  236  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC  309

Query  367  CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACG  440
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  310  CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG  383

Query  441  TGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG  514
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  384  CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG  457

Query  515  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  458  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC  531

Query  589  ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC  662
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  532  ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC  605

Query  663  CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT  736
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  606  CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT  679

Query  737  ACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTC  810
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  680  ACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTC  753

Query  811  AGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC  884
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  CGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC  827

Query  885  CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG-------  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||       
Sbjct  828  CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACAT  901

Query  947  --CAGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC---------  977
              ||..|||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||         
Sbjct  902  CTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAA  973

Query  978  -----AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC-------------  1017
                 ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||             
Sbjct  974  TTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGC  1033

Query 1018  -----AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCC  1063
                 ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.
Sbjct 1034  TGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCG  1107

Query 1064  TTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG------  1124
            |||...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||      
Sbjct 1108  TTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGG  1170

Query 1125  -----CCGATTTGCCCCCTAC------------  1140
                 |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1171  GCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1200