Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006521599.2
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1022
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA--  15
                                                                     |||||.....||.||  
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG  222

Query   16  -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT  88
             ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT  292

Query   89  TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC  162
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC  366

Query  163  GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC  235
            .||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  367  AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC  439

Query  236  AAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  309
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  513

Query  310  TCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCG  383
            |||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  514  TCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCG  587

Query  384  GCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCG  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  588  GCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCG  661

Query  458  GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGC  735

Query  532  CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGG  605
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  736  CGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGG  809

Query  606  TTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATG  679
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  810  CTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATG  883

Query  680  TGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGT  753
            ||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct  884  TGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGT  957

Query  754  CTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAG  827
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  958  CTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAG  1031

Query  828  GGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGG  901
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1032  GGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG-----  1100

Query  902  TTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACT  975
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  -----------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACT  1139

Query  976  GCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGA  1049
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1140  GCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGA  1213

Query 1050  CCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACA  1123
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1214  CCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACA  1287

Query 1124  GCCGATTTGCCCCCTAC----------  1140
            |||||||||||||||||          
Sbjct 1288  GCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG  1314