Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_006724191.1
• Aligned Length: 1185
• Identities: 1140
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAAC  222

Query  223  TCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGAC  293
            |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGAC  296

Query  294  ACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCC  370

Query  368  GGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGT  444

Query  442  GGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGG  518

Query  516  CACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCA  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCA  592

Query  590  CACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCC  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCC  666

Query  664  AGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTA  740

Query  738  CATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCA  814

Query  812  GAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCC  888

Query  886  GCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT-----------------------  936
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  889  GCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAATCTGCAAACTGCTTCAG  962

Query  937  ---------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGC  1001
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGC  1036

Query 1002  CGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCG  1075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCG  1110

Query 1076  CTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC---------  1140
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1111  CTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGAC  1184

Query 1141  -  1140
             
Sbjct 1185  G  1185