Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02790
• Subject: XM_017028691.1
• Aligned Length: 1201
• Identities: 1129
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ------------------ATGGA-GAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG  55
                              ||||| .|..||.|...||.|..| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATGGTGTATATTGTATGGATTATCAATATCCTGTTGTC-CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG  73

Query   56  ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG  147

Query  130  GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA  221

Query  204  CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACG  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACG  295

Query  278  GCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAAT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAAT  369

Query  352  ATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAAT  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAAT  443

Query  426  AATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCA  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  AATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCA  517

Query  500  GGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACC  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACC  591

Query  574  AATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  AATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGA  665

Query  648  GTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAG  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAG  739

Query  722  GGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACC  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACC  813

Query  796  ACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACC  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACC  887

Query  870  TCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT-------  936
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  888  TCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAAT  961

Query  937  -------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAG  985
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAG  1035

Query  986  CCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCAT  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCAT  1109

Query 1060  GCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGC  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGC  1183

Query 1134  CCCCTAC----------  1140
            |||||||          
Sbjct 1184  CCCCTACTGAAGTGACG  1200