Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02790
- Subject:
- XM_024452192.1
- Aligned Length:
- 1182
- Identities:
- 1068
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------ATGGTTCAGCCTTT 14
Query 75 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 88
Query 149 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAAC 162
Query 223 TCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 TCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACA 236
Query 297 AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGG 310
Query 371 ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGC 384
Query 445 TCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 TCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCAC 458
Query 519 CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACAC 532
Query 593 CATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 CATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGC 606
Query 667 TTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 TTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACAT 680
Query 741 TCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAG 814
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 TCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAG 742
Query 815 GAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 GAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCC 816
Query 889 TATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT-------------------------- 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 TATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAATCTGCAAACTGCTTCAGATC 890
Query 937 ------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGC 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 AAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGC 964
Query 1005 TGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 TGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTA 1038
Query 1079 GCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC---------- 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 GCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG 1110