Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02825
- Subject:
- XM_017017452.2
- Aligned Length:
- 1797
- Identities:
- 1678
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATGTCCGCATCCGCCCAGCAGCTGGCGGAGGAGCTGCAGATCTTCGGCCTAGACTGCGAGGAGGCTCTAATTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCGCATCCGCCCAGCAGCTGGCGGAGGAGCTGCAGATCTTCGGCCTAGACTGCGAGGAGGCTCTAATTGA 74
Query 75 GAAATTGGTAGAGCTTTGTGTTCAGTATGGACAGAATGAGGAGGGAATGGTAGGCGAGCTTATAGCCTTCTGCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAATTGGTAGAGCTTTGTGTTCAGTATGGACAGAATGAGGAGGGAATGGTAGGCGAGCTTATAGCCTTCTGCA 148
Query 149 CCAGCACACATAAAGTTGGCCTTACCTCAGAGATCCTGAACTCTTTTGAGCATGAGTTTCTGAGCAAAAGATTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAGCACACATAAAGTTGGCCTTACCTCAGAGATCCTGAACTCTTTTGAGCATGAGTTTCTGAGCAAAAGATTA 222
Query 223 TCGAAAGCCAGGCATAGTACCTGCAAGGACAGTGGCCATGCAGGAGCTAGAGACATTGTTTCCATTCAAGAGCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCGAAAGCCAGGCATAGTACCTGCAAGGACAGTGGCCATGCAGGAGCTAGAGACATTGTTTCCATTCAAGAGCT 296
Query 297 AATTGAAGTGGAAGAAGAAGAGGAAATCCTCTTGAACTCTTACACCACACCTTCAAAGGGTTCTCAGAAGCGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATTGAAGTGGAAGAAGAAGAGGAAATCCTCTTGAACTCTTACACCACACCTTCAAAGGGTTCTCAGAAGCGAG 370
Query 371 CTATCTCTACCCCAGAAACCCCCCTAACAAAAAGGAGTGTGTCAACTCGTAGCCCCCATCAGCTACTCTCACCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTATCTCTACCCCAGAAACCCCCCTAACAAAAAGGAGTGTGTCAACTCGTAGCCCCCATCAGCTACTCTCACCG 444
Query 445 TCAAGTTTCTCTCCAAGTGCTACTCCCTCCCAGAAATACAACTCACGAAGTAACCGAGGAGAAGTGGTTACCTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAAGTTTCTCTCCAAGTGCTACTCCCTCCCAGAAATACAACTCACGAAGTAACCGAGGAGAAGTGGTTACCTC 518
Query 519 CTTCGGCTTAGCACAGGGAGTATCTTGGTCTGGGAGAGGAGGAGCTGGAAACATCAGCCTGAAGGTCTTGGGAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTCGGCTTAGCACAGGGAGTATCTTGGTCTGGGAGAGGAGGAGCTGGAAACATCAGCCTGAAGGTCTTGGGAT 592
Query 593 GTCCAGAGGCACTAACTGGGAGCTACAAATCCATGTTTCAGAAGCTCCCAGACATTCGAGAAGTTCTGACCTGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCCAGAGGCACTAACTGGGAGCTACAAATCCATGTTTCAGAAGCTCCCAGACATTCGAGAAGTTCTGACCTGT 666
Query 667 AAGATAGAAGAACTTGGCAGCGAACTCAAGGAACATTACAAGATTGAAGCTTTCACTCCTTTGCTAGCCCCAGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGATAGAAGAACTTGGCAGCGAACTCAAGGAACATTACAAGATTGAAGCTTTCACTCCTTTGCTAGCCCCAGC 740
Query 741 ACAGGAGCCTGTCACTCTGCTGGGCCAGATTGGCTGTGATAGCAACGGGAAGCTGAACAACAAGTCAGTGATTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGGAGCCTGTCACTCTGCTGGGCCAGATTGGCTGTGATAGCAACGGGAAGCTGAACAACAAGTCAGTGATTC 814
Query 815 TCGAGGGAGACCGGGAACATTCCTCGGGTGCTCAAATTCCAGTGGATTTATCTGAGCTTAAGGAATATTCTCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCGAGGGAGACCGGGAACATTCCTCGGGTGCTCAAATTCCAGTGGATTTATCTGAGCTTAAGGAATATTCTCTG 888
Query 889 TTTCCTGGACAGGTTGTAATTATGGAAGGAATCAACACCACTGGTAGGAAACTTGTTGCCACCAAACTCTACGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTCCTGGACAGGTTGTAATTATGGAAGGAATCAACACCACTGGTAGGAAACTTGTTGCCACCAAACTCTACGA 962
Query 963 GGGTGTGCCACTTCCATTTTATCAGCCCACTGAAGAGGATGCAGACTTTGAGCAAAGCATGGTCCTGGTTGCCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGTGTGCCACTTCCATTTTATCAGCCCACTGAAGAGGATGCAGACTTTGAGCAAAGCATGGTCCTGGTTGCCT 1036
Query 1037 GTGGACCATACACCACATCTGACAGCATCACGTATGACCCCCTGCTTGACCTGATTGCTGTCATCAACCATGAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGGACCATACACCACATCTGACAGCATCACGTATGACCCCCTGCTTGACCTGATTGCTGTCATCAACCATGAC 1110
Query 1111 CGGCCAGATGTCTGCATCCTGTTTGGCCCTTTCCTGGATGCTAAGCATGAACAGGTGGAGAATTGTCTACTGAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGCCAGATGTCTGCATCCTGTTTGGCCCTTTCCTGGATGCTAAGCATGAACAGGTGGAGAATTGTCTACTGAC 1184
Query 1185 AAGTCCATTTGAAGACATTTTCAAGCAGTGTCTACGAACAATTATTGAAGGCACAAGAAGCTCCGGCTCCCACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGTCCATTTGAAGACATTTTCAAGCAGTGTCTACGAACAATTATTGAAGGCACAAGAAGCTCCGGCTCCCACC 1258
Query 1259 TTGTCTTTGTCCCGTCATTGAGAGATGTGCACCATGAGCCTGTGTACCCCCAGCCGCCTTTCAGCTACTCCGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTGTCTTTGTCCCGTCATTGAGAGATGTGCACCATGAGCCTGTGTACCCCCAGCCGCCTTTCAGCTACTCCGAT 1332
Query 1333 CTGTCTCGAGAGGACAAAAAGCAAGTACAGTTTGTGTCCGAGCCCTGCAGCCTCTCCATAAACGGAGTGATCTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGTCTCGAGAGGACAAAAAGCAAGTACAGTTTGTGTCCGAGCCCTGCAGCCTCTCCATAAACGGAGTGATCTT 1406
Query 1407 CGGCTTGACATCCACAGATCTGCTTTTCCACCTGGGGGCCGAGGAGATCAGTAGTTCTTCCGGAACTTCAGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGGCTTGACATCCACAGATCTGCTTTTCCACCTGGGGGCCGAGGAGATCAGTAGTTCTTCCGGAACTTCAGACA 1480
Query 1481 GATTCAGCCGAATACTCAAGCACATCTTGACCCAGAGGAGCTACTACCCACTCTACCCGCCCCAAGAAGACATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GATTCAGCCGAATACTCAAGCACATCTTGACCCAGAGGAGCTACTACCCACTCTACCCGCCCCAAGAAGACATG 1554
Query 1555 GCCATTGACTATGAGTCGTTCTATGTTTACGCACAGCTGCCTGTCACCCCAGATGTCCTCATCATCCCGTCAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCCATTGACTATGAGTCGTTCTATGTTTACGCACAGCTGCCTGTCACCCCAGATGTCCTCATCATCCCGTCAGA 1628
Query 1629 GCTGAGGTACTTCGTGAA---GGATGTCCTCGGCTGTGTCTGTGTGAACCCTGGGCGCCTTACCAAAGGGCAGG 1699
|||||||||||||||||| ||| || |||| .||||| |||| ||||
Sbjct 1629 GCTGAGGTACTTCGTGAAGACGGA-GT-CTCG-----ATCTGT------------CGCC-----------CAGG 1672
Query 1700 TGGGAGGCACCTTCGCCCGACTCTACCTTAGGAGGCCGGCAGCGGACGGGGCAGAGAGGCAGAGCCCATGCATT 1773
..|||| .||||.||
Sbjct 1673 CTGGAG-------------------------------TGCAGTGG----------------------------- 1686
Query 1774 GCTGTGCAGGTCGTCAGGATC 1794
Sbjct 1687 --------------------- 1686