Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02860
• Subject: XM_006724225.4
• Aligned Length: 1273
• Identities: 974
• Gaps: 299

Alignment

Query    1  ATGGCAGGGAAAGTAAAATGGGTCACTGATATCGAGAAGTCAGTGCTGATCAATAACTTTGAAAAGAGAGGATG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTCCAAGTGACAGAAAACGAGGACTGGAATTTTTACTGGATGAGTGTGCAAACCATCCGAAATGTGTTCAGCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGAAGCTGGATATCGGCTCTCAGATGACCAAATAGTCAACCATTTTCCAAACCACTATGAACTGACCCGGAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACCTGATGGTGAAGAACATCAAAAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAAGAAGGGAGTCCTCTGGCAGAAAAAGA  296
                                                                                     |
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------------A  1

Query  297  TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGG----ACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTG  366
            ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    2  TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGGGTTTACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTG  75

Query  367  TTTGTAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGG  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   76  TTTGTAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGG  149

Query  441  CATCTTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  CATCTTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTC  223

Query  515  AATCTAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGAC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  AATCTAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGAC  297

Query  589  CTGCGCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTT  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  CTGCGCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTT  371

Query  663  CTGCACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCC  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  CTGCACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCC  445

Query  737  AGAAACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAG  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  AGAAACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAG  519

Query  811  AGCACCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGC  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  AGCACCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGC  593

Query  885  TGTGGCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGC  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  TGTGGCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGC  667

Query  959  TGAAGCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAG  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  TGAAGCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAG  741

Query 1033  TACAACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTC  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  TACAACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTC  815

Query 1107  GCCACCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACC  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  GCCACCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACC  889

Query 1181  GGGAGCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTC  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  GGGAGCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTC  963

Query 1255  CTCACCACCTGGAAG  1269
            |||||||||||||||
Sbjct  964  CTCACCACCTGGAAG  978