Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02860
- Subject:
- XM_011245659.2
- Aligned Length:
- 1270
- Identities:
- 1102
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGGCAGGGAA-AGTAAAATGGGTCACTGATATCGAGAAGTCAGTGCTGATCAATAACTTTGAAAAGAGAGGAT 73
||||| ||||| .||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 1 ATGGC-GGGAAGGGTGAAGTGGGTCACTGACATTGAGAAGTCGGTACTAATCAACAACTTCGAGAAGAGAGGGT 73
Query 74 GGGTCCAAGTGACAGAAAACGAGGACTGGAATTTTTACTGGATGAGTGTGCAAACCATCCGAAATGTGTTCAGC 147
||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 74 GGATCCAAGTGACAGAAAATGAAGACTGGAATTTTTACTGGATGAGCGTGCAAACCATTCGCAACGTGTTCAGC 147
Query 148 GTTGAAGCTGGATATCGGCTCTCAGATGACCAAATAGTCAACCATTTTCCAAACCACTATGAACTGACCCGGAA 221
||.|||.||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 148 GTAGAAACTGGGTACCGGCTGTCAGACGACCAGATCGTCAACCATTTCCCCAACCACTACGAGCTGACCCGCAA 221
Query 222 GGACCTGATGGTGAAGAACATCAAAAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAAGAAGGGAGTCCTCTGGCAGAAAAAG 295
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..||||.||.||||
Sbjct 222 GGACCTGATGGTGAAGAACATTAAGAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAGGAAGGAAGTCCCTTGGCGGAGAAAG 295
Query 296 ATGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGGACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTGTTT 369
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 296 ACGAGAATGGAAAATACCTCTATCTGGACTTTGTCCCCGTCACCTACATGCTCCCCGCCGACTACAACCTGTTT 369
Query 370 GTAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGGCAT 443
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 370 GTGGAAGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCATGTGGCAAAGCACAGGGAAAAGGCAT 443
Query 444 CTTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTCAAT 517
||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 444 CTTCCTCATCAATAAGCTTTCGCAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACGTCCTCGTTTGTGTCGCAGT 517
Query 518 CTAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGACCTG 591
|.|..||.|||||.|||||||||||..|||||||.||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 518 CCACAAAAGAAGCGTACGTGATCTCAGTCTATATCAATAATCCGTTGCTCATCGGTGGAAGGAAGTTTGACCTT 591
Query 592 CGCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTTCTG 665
||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 592 CGTCTGTATGTCCTGGTGTCCACGTACCGCCCGCTGCGCTGCTACATGTACAAGCTTGGGTTCTGCCGCTTCTG 665
Query 666 CACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCCAGA 739
|||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 666 CACAGTGAAGTACACCCCTAGTACCAGTGAGCTCGACAACATGTTTGTCCACCTTACCAACGTGGCCATCCAGA 739
Query 740 AACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAGAGC 813
|.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|..||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 740 AGCATGGGGAGGACTACAACCACATCCACGGTGGCAAGTGGACTGTCAACAACCTGCGTCTCTACCTGGAGAGC 813
Query 814 ACCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGCTGT 887
|||||.|||...||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 814 ACCCGAGGCCGAGAGGTGACCAGCAAGCTGTTTGATGAAATCCACTGGATCATCGTGCAGTCTCTCAAGGCCGT 887
Query 888 GGCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGCTGA 961
||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 888 GGCGCCAGTGATGAACAACGACAAACACTGCTTTGAATGCTACGGCTACGACATCATCATCGATGACAAGCTGA 961
Query 962 AGCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAGTAC 1035
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 962 AGCCCTGGCTGATCGAGGTCAACGCGTCCCCGTCTCTCACATCCAGCACCGCCAACGATCGAATCCTTAAGTAC 1035
Query 1036 AACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTCGCC 1109
|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1036 AACCTGATTAACGACACCCTCAACATTGCGGTCCCCAACGGCGAGATTCCCGACTGCAAGTGGAACAAGTCTCC 1109
Query 1110 ACCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACCGGG 1183
.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1110 CCCCAAGGAAGTACTTGGCAACTATGAGATCCTGTATGACGAGGAGCTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGAACGAG 1183
Query 1184 AGCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTCCTC 1257
||||.||||.|||.|..||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||...||||||
Sbjct 1184 AGCTTAGAAACCGCCCAGGCCAGCCAGTGGGGCCCAGAGCAGGCCGCTCGAGAGACTCAGGAAGAAGTGTCCTC 1257
Query 1258 ACCACCTGGAAG 1269
||.|||||||||
Sbjct 1258 ACAACCTGGAAG 1269