Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02865
• Subject: NM_178624.6
• Aligned Length: 1269
• Identities: 1116
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTTTTCTCAAACAATGATGAAGGCCTTATTAACAAAAAGTTACCCAAAGAACTTCTGTTAAGAATATTTTC  74
            ||||||||||||||||.||||||.||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGTTTTCTCAAACAGTGATGATGGCCTTATCAACAAGAAGCTACCCAAGGAGCTCCTCTTGAGAATATTCTC  74

Query   75  CTTCTTGGATATAGTAACTTTGTGCCGATGTGCACAGATTTCCAAGGCTTGGAACATCTTAGCCCTGGATGGAA  148
            |||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CTTCTTGGACATCGTAACTCTATGCCGATGTGCACAGATCTCCAAGGCCTGGAACATCTTAGCCCTGGATGGCA  148

Query  149  GCAACTGGCAAAGAATAGATCTTTTTAACTTTCAAACAGATGTAGAGGGTCGAGTGGTGGAAAATATCTCGAAG  222
            |||||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  GCAACTGGCAACGGGTGGATCTTTTTAACTTCCAGACAGATGTAGAGGGCCGAGTGGTGGAAAACATCTCCAAG  222

Query  223  CGATGCGGTGGATTCCTGAGGAAGCTCAGCTTGCGAGGCTGCATTGGTGTTGGGGATTCCTCCTTGAAGACCTT  296
            .|.||||||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  223  AGGTGCGGTGGCTTCCTTAGAAAGCTCAGCCTGCGTGGCTGCATCGGAGTCGGGGACTCCTCTTTGAAGACCTT  296

Query  297  TGCACAGAACTGCCGAAACATTGAACATTTGAACCTCAATGGATGCACAAAAATCACTGACAGCACGTGTTATA  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TGCACAGAACTGCCGGAACATTGAACATTTAAACCTCAATGGCTGCACGAAAATCACTGACAGCACGTGTTACA  370

Query  371  GCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACATCTGGATCTGACCTCCTGTGTGTCTATTACAAACAGCTCCTTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.
Sbjct  371  GCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACACCTGGATCTCACGTCCTGCGTGTCTGTTACCAACAGCTCTTTA  444

Query  445  AAGGGGATCAGTGAGGGCTGCCGAAACCTGGAGTACCTGAACCTCTCTTGGTGTGATCAGATCACGAAGGATGG  518
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  445  AAGGGCATCAGCGAGGGCTGCCGGAACCTGGAATATCTGAACCTCTCCTGGTGTGACCAGATCACAAAGGAAGG  518

Query  519  CATCGAGGCACTGGTGCGAGGTTGTCGAGGCCTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGCTGCACACAGTTAGAAGATG  592
            |||.|||||.||||||||.||.||.||.||..||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  CATTGAGGCGCTGGTGCGGGGGTGCCGGGGTTTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGTTGTACACAGTTAGAGGACG  592

Query  593  AAGCTCTGAAACACATTCAGAATTACTGCCATGAGCTTGTGAGCCTCAACTTGCAGTCCTGCTCACGTATCACG  666
            ||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  593  AAGCTCTGAAACACATTCAGAACCACTGCCACGAGCTGGTGAGCCTCAACCTGCAGTCCTGCTCACGCATCACT  666

Query  667  GATGAAGGTGTGGTGCAGATATGCAGGGGCTGTCACCGGCTACAGGCTCTCTGCCTTTCGGGTTGCAGCAACCT  740
            |||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct  667  GATGATGGCGTGGTGCAGATCTGCAGGGGCTGCCACCGGCTACAGGCTCTGTGCCTCTCGGGTTGTAGCAACCT  740

Query  741  CACAGATGCCTCTCTTACAGCCCTGGGTTTGAACTGTCCGCGACTGCAAATTTTGGAGGCTGCCCGATGCTCCC  814
            .||.|||||.|||||.||||||.||||..|||||||.||..||||.|||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  TACGGATGCATCTCTCACAGCCTTGGGCCTGAACTGCCCCAGACTACAAGTTTTGGAGGCTGCCCGGTGCTCCC  814

Query  815  ATTTGACTGACGCAGGTTTTACACTTTTAGCTCGGAATTGCCACGAATTGGAGAAGATGGATCTTGAAGAATGC  888
            ||.||||.||||||||.||||||||..||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  ATCTGACCGACGCAGGCTTTACACTGCTAGCTCGGAATTGCCATGAGCTGGAGAAGATGGACCTTGAAGAATGT  888

Query  889  ATCCTGATAACCGACAGCACACTCATCCAGCTCTCCATTCACTGTCCTAAACTGCAAGCCCTGAGCCTGTCCCA  962
            .|||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct  889  GTCCTGATTACCGACAGCACCCTCGTCCAGCTCTCCATCCACTGTCCCAAGCTGCAAGCCCTGAGCTTGTCCCA  962

Query  963  CTGTGAACTCATCACAGATGATGGGATCCTGCACCTGAGCAACAGTACCTGTGGCCATGAGAGGCTGCGGGTAC  1036
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  963  CTGTGAGCTCATCACAGATGAGGGGATCCTGCACCTGAGCAGCAGCACCTGTGGGCACGAGAGACTCCGGGTGC  1036

Query 1037  TGGAGTTGGACAACTGCCTCCTCATCACTGATGTGGCCCTGGAACACCTAGAGAACTGCCGAGGCCTGGAGCGC  1110
            |||||.|||||||||||||.||..||||.||.|...|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TGGAGCTGGACAACTGCCTTCTTGTCACGGACGCCTCGCTGGAGCACCTGGAGAACTGCCGAGGCCTGGAGCGA  1110

Query 1111  CTCGAGCTGTACGACTGCCAGCAGGTTACCCGTGCAGGCATCAAGCGGATGCGGGCTCAGCTCCCTCATGTCAA  1184
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  CTGGAGCTTTACGACTGCCAGCAGGTCACCCGTGCAGGCATCAAGCGCATGCGGGCTCAGCTTCCTCATGTCAA  1184

Query 1185  AGTCCACGCCTACTTTGCTCCCGTCACCCCACCGACAGCAGTGGCAGGAAGTGGACAGCGACTGTGCAGGTGCT  1258
            ||||||.||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185  AGTCCATGCCTACTTTGCTCCAGTCACCCCTCCACCAGCAGTGGCAGGAAGTGGACATCGACTGTGCAGATGCT  1258

Query 1259  GTGTCATTCTC  1269
            |||||||.|||
Sbjct 1259  GTGTCATACTC  1269