Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02865
• Subject: XR_379880.3
• Aligned Length: 1570
• Identities: 1116
• Gaps: 301

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TTGAGGCCGGGGCGGGGCGTCGGGCTGGCGTCACCAGGACAACGGGCGTCGCCGGCGCCGTGTGACTTCAGGCT  74

Query    1  ------------------ATGGTTTTCTCAAACAATGATGAAGGCCTTATTAACAAAAAGTTACCCAAAGAACT  56
                              ||||||||||||||||.||||||.||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||
Sbjct   75  GTGGGCGCGCTCGCGGCCATGGTTTTCTCAAACAGTGATGATGGCCTTATCAACAAGAAGCTACCCAAGGAGCT  148

Query   57  TCTGTTAAGAATATTTTCCTTCTTGGATATAGTAACTTTGTGCCGATGTGCACAGATTTCCAAGGCTTGGAACA  130
            .||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  149  CCTCTTGAGAATATTCTCCTTCTTGGACATCGTAACTCTATGCCGATGTGCACAGATCTCCAAGGCCTGGAACA  222

Query  131  TCTTAGCCCTGGATGGAAGCAACTGGCAAAGAATAGATCTTTTTAACTTTCAAACAGATGTAGAGGGTCGAGTG  204
            ||||||||||||||||.||||||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  223  TCTTAGCCCTGGATGGCAGCAACTGGCAACGGGTGGATCTTTTTAACTTCCAGACAGATGTAGAGGGCCGAGTG  296

Query  205  GTGGAAAATATCTCGAAGCGATGCGGTGGATTCCTGAGGAAGCTCAGCTTGCGAGGCTGCATTGGTGTTGGGGA  278
            ||||||||.|||||.|||.|.||||||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  297  GTGGAAAACATCTCCAAGAGGTGCGGTGGCTTCCTTAGAAAGCTCAGCCTGCGTGGCTGCATCGGAGTCGGGGA  370

Query  279  TTCCTCCTTGAAGACCTTTGCACAGAACTGCCGAAACATTGAACATTTGAACCTCAATGGATGCACAAAAATCA  352
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  371  CTCCTCTTTGAAGACCTTTGCACAGAACTGCCGGAACATTGAACATTTAAACCTCAATGGCTGCACGAAAATCA  444

Query  353  CTGACAGCACGTGTTATAGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACATCTGGATCTGACCTCCTGTGTGTCT  426
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  445  CTGACAGCACGTGTTACAGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACACCTGGATCTCACGTCCTGCGTGTCT  518

Query  427  ATTACAAACAGCTCCTTGAAGGGGATCAGTGAGGGCTGCCGAAACCTGGAGTACCTGAACCTCTCTTGGTGTGA  500
            .||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  519  GTTACCAACAGCTCTTTAAAGGGCATCAGCGAGGGCTGCCGGAACCTGGAATATCTGAACCTCTCCTGGTGTGA  592

Query  501  TCAGATCACGAAGGATGGCATCGAGGCACTGGTGCGAGGTTGTCGAGGCCTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGCT  574
            .||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  593  CCAGATCACAAAGGAAGGCATTGAGGCGCTGGTGCGGGGGTGCCGGGGTTTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGTT  666

Query  575  GCACACAGTTAGAAGATGAAGCTCTGAAACACATTCAGAATTACTGCCATGAGCTTGTGAGCCTCAACTTGCAG  648
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GTACACAGTTAGAGGACGAAGCTCTGAAACACATTCAGAACCACTGCCACGAGCTGGTGAGCCTCAACCTGCAG  740

Query  649  TCCTGCTCACGTATCACGGATGAAGGTGTGGTGCAGATATGCAGGGGCTGTCACCGGCTACAGGCTCTCTGCCT  722
            |||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  741  TCCTGCTCACGCATCACTGATGATGGCGTGGTGCAGATCTGCAGGGGCTGCCACCGGCTACAGGCTCTGTGCCT  814

Query  723  TTCGGGTTGCAGCAACCTCACAGATGCCTCTCTTACAGCCCTGGGTTTGAACTGTCCGCGACTGCAAATTTTGG  796
            .||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||.||||..|||||||.||..||||.|||.||||||
Sbjct  815  CTCGGGTTGTAGCAACCTTACGGATGCATCTCTCACAGCCTTGGGCCTGAACTGCCCCAGACTACAAGTTTTGG  888

Query  797  AGGCTGCCCGATGCTCCCATTTGACTGACGCAGGTTTTACACTTTTAGCTCGGAATTGCCACGAATTGGAGAAG  870
            ||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||..||||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct  889  AGGCTGCCCGGTGCTCCCATCTGACCGACGCAGGCTTTACACTGCTAGCTCGGAATTGCCATGAGCTGGAGAAG  962

Query  871  ATGGATCTTGAAGAATGCATCCTGATAACCGACAGCACACTCATCCAGCTCTCCATTCACTGTCCTAAACTGCA  944
            |||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  963  ATGGACCTTGAAGAATGTGTCCTGATTACCGACAGCACCCTCGTCCAGCTCTCCATCCACTGTCCCAAGCTGCA  1036

Query  945  AGCCCTGAGCCTGTCCCACTGTGAACTCATCACAGATGATGGGATCCTGCACCTGAGCAACAGTACCTGTGGCC  1018
            ||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||.|
Sbjct 1037  AGCCCTGAGCTTGTCCCACTGTGAGCTCATCACAGATGAGGGGATCCTGCACCTGAGCAGCAGCACCTGTGGGC  1110

Query 1019  ATGAGAGGCTGCGGGTACTGGAGTTGGACAACTGCCTCCTCATCACTGATGTGGCCCTGGAACACCTAGAGAAC  1092
            |.|||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||.||..||||.||.|...|.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1111  ACGAGAGACTCCGGGTGCTGGAGCTGGACAACTGCCTTCTTGTCACGGACGCCTCGCTGGAGCACCTGGAGAAC  1184

Query 1093  TGCCGAGGCCTGGAGCGCCTCGAGCTGTACGACTGCCAGCAGGTTACCCGTGCAGGCATCAAGCGGATGCGGGC  1166
            |||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1185  TGCCGAGGCCTGGAGCGACTGGAGCTTTACGACTGCCAGCAGGTCACCCGTGCAGGCATCAAGCGCATGCGGGC  1258

Query 1167  TCAGCTCCCTCATGTCAAAGTCCACGCCTACTTTGCTCCCGTCACCCCACCGACAGCAGTGGCAGGAAGTGGAC  1240
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGCTTCCTCATGTCAAAGTCCATGCCTACTTTGCTCCAGTCACCCCTCCACCAGCAGTGGCAGGAAGTGGAC  1332

Query 1241  AGCGACTGTGCAGGTGCTGTGTCATTCTC---------------------------------------------  1269
            |.|||||||||||.|||||||||||.|||                                             
Sbjct 1333  ATCGACTGTGCAGATGCTGTGTCATACTCTGACAGCAGCTGCTTAGGCCACGGGCCCCATCCTCCAGGTTAGAC  1406

Query 1270  --------------------------------------------------------------------------  1269
                                                                                      
Sbjct 1407  CAGTCTCCTGGCTGTTCCATCGTCACCCTATCTCGACTCTCCATGGTGAAAACATTACAGGACTTGACCCTACA  1480

Query 1270  --------------------------------------------------------------------------  1269
                                                                                      
Sbjct 1481  GCTGCTCCTAGTGCTTGCTCGGCAGTCCCGCGCTCACATCAGAGTCTGAGGGAGTATGGGAAGGAAACGCCCTC  1554

Query 1270  ----------------  1269
                            
Sbjct 1555  AATACCCACCGGAGGG  1570