Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02867
- Subject:
- XM_006520804.2
- Aligned Length:
- 1329
- Identities:
- 1112
- Gaps:
- 108
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGGTGTGCGCGCGCTTTGCACACAGGCCAGCCCGTCACTCACGGCACGAGATCCTCTCAGGGAGCCTGCT 74
Query 1 -------------ATGACAGTGAGGGGGGATGTGCTGGCCCCGGATCCAGCGTCGCCCACGACCGCAGCAGCCT 61
||||||||||||||||..|.|||||||||.||.||||||||.|||||.|||.||.||||.|
Sbjct 75 GCTGCTGGGAACCATGACAGTGAGGGGGGCCGCGCTGGCCCCAGACCCAGCGTCACCCACAACCACAACAGCTT 148
Query 62 CGCCCAGCGTCTCCGTGATCCCCGAGGGCAGCCCCACTGCCATGGAGCAGCCTGTGTTCCTGATGACAACTGCC 135
|.||.||||||||.|..|.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CACCTAGCGTCTCTGCCACCCCCGAGGGCAGCCCCACAGCCATGGAGCACCCTGTGTTCCTGATGACCACTGCC 222
Query 136 GCTCAGGCCATCTCTGGCTTCTTCGTGTGGACGGCCCTGCTCATCACATGCCACCAGATCTACATGCACCTGCG 209
||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 GCCCAGGCCATCTCCGGCTTCTTTGTGTGGACAGCTCTGCTCATCACTTGCCACCAGATCTACATGCATCTGCG 296
Query 210 CTGCTACAGCTGCCCCAACGAGCAGCGCTACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTTGACT 283
||||||||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 CTGCTACAGCCGTCCCAATGAGCAGCGCCACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTCGACT 370
Query 284 CCTGGCTCAGCCTCCTCTTCTTCACCAACGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGCGACTGCTATGAG 357
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 CCTGGCTCAGCCTCCTCTTCTTCACCAATGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGAGACTGCTATGAG 444
Query 358 GCCTTGGTCATCTATAATTTCCTGAGCCTGTGCTATGAGTACCTAGGAGGAGAAAGTTCCATCATGTCGGAGAT 431
|||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct 445 GCCTTTGTCATCTATAACTTCCTGAGCTTGTGCTATGAGTACCTCGGGGGAGAGAGTGCCATCATGTCTGAGAT 518
Query 432 CAGAGGAAAACCCATTGAGTCCAGCTGTATGTATGGCACCTGCTGCCTCTGGGGAAAGACTTATTCCATCGGAT 505
||||||.||..||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 519 CAGAGGGAAGGCCATTGAGTCCAGCTGTATGTACGGCACGTGCTGCCTCTGGGGAAAGACCTACTCCATCGGAT 592
Query 506 TTCTGAGGTTCTGCAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCGGTCAGCACTGTGGTC 579
|.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.
Sbjct 593 TCCTGCGGTTCTGTAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCCGTCAGCACCGTTATA 666
Query 580 CTCCAGGCCTTCGGCAAGTACCGGGATGGGGACTTTGACGTCACCAGTGGCTACCTCTACGTGACCATCATCTA 653
|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCCAGGCCTTTGGCAAGTACCGGGACGGAGACTTTGATGTCACCAGTGGGTACCTCTACGTGACCATCATCTA 740
Query 654 CAACATCTCCGTCAGCCTGGCCCTCTACGCCCTCTTCCTCTTCTACTTCGCCACCCGGGAGCTGCTCAGCCCCT 727
||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACATCTCCGTCAGCCTGGCCCTATATGCGCTCTTCCTCTTCTACTTTGCCACAAGGGAGCTGCTCAGCCCCT 814
Query 728 ACAGCCCCGTCCTCAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATCTTTCTTTCCTTCTGGCAAGGCATGCTCCTGGCC 801
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 ACAGCCCTGTCCTCAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATATTCCTCTCCTTCTGGCAAGGCATGCTGCTGGCC 888
Query 802 ATCCTGGAGAAGTGTGGGGCCATCCCCAAAATCCACTCGGCCCGCGTGTCGGTGGGCGAGGGCACCGTGGCTGC 875
|||.|.||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCTTAGAGAAGTGCGGGGCCATCCCCAAGATCAACTCAGCGCGAGTGTCAGTGGGTGAGGGCACCGTGGCTGC 962
Query 876 CGGCTACCAGGACTTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTTGCAGCCCTGGCCCTGCGGCACGCCTTCACCTACA 949
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 CGGCTACCAGGACTTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTCGCGGCCTTGGCCCTGCGGCATGCCTTCACCTACA 1036
Query 950 AGGTCTATGCTGACAAGAGGCTGGACGCACAA---------------------GGCCGCTGTGCCCCCATGAAG 1002
|||||||.|||||||||||.||||||||.||| ||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 AGGTCTACGCTGACAAGAGACTGGACGCTCAAGTGCTGACGTACGGCCCATACGGCCGCTGCGCCCCCATGAAG 1110
Query 1003 AGCATCTCCAGCAGCCTCAAGGAGACCATGAACCCGCACGACATCGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCACC 1076
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 AGCATCTCCAGCAGCCTCAAAGAGACCATGAACCCACACGATATTGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCGCC 1184
Query 1077 TGCCTACCAGCAGTACACGCAGCAGTCCACCCTGGAGCCTGGGCCCACCTGGCGTGGTGGCGCCCACGGCCTCT 1150
.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||.||||.|
Sbjct 1185 AGCCTACCAGCAGTACACGCAGCAGTCCACTCTGGAGCCCGGGCCCACCTGGCGTGGCGGCACGCACAGCCTTT 1258
Query 1151 CCCGCTCCCACAGCCTCAGTGGCGCCCGCGACAACGAGAAGACTCTCCTGCTCAGCTCTGATGATGAATTC 1221
||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 CCCGCTCCCACAGCCTTAGTGGTGCACGCGACAATGAGAAGACTCTGCTGCTCAGCTCTGATGATGAGTTC 1329