Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02867
• Subject: XM_006520805.3
• Aligned Length: 1308
• Identities: 1112
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGTGTGCGCGCGCTTTGCACACAGGCCAGCCCGTCACTCACGGCACGAGATCCTCTCAGGGAGCCTGCT  74

Query    1  -------------ATGACAGTGAGGGGGGATGTGCTGGCCCCGGATCCAGCGTCGCCCACGACCGCAGCAGCCT  61
                         ||||||||||||||||..|.|||||||||.||.||||||||.|||||.|||.||.||||.|
Sbjct   75  GCTGCTGGGAACCATGACAGTGAGGGGGGCCGCGCTGGCCCCAGACCCAGCGTCACCCACAACCACAACAGCTT  148

Query   62  CGCCCAGCGTCTCCGTGATCCCCGAGGGCAGCCCCACTGCCATGGAGCAGCCTGTGTTCCTGATGACAACTGCC  135
            |.||.||||||||.|..|.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CACCTAGCGTCTCTGCCACCCCCGAGGGCAGCCCCACAGCCATGGAGCACCCTGTGTTCCTGATGACCACTGCC  222

Query  136  GCTCAGGCCATCTCTGGCTTCTTCGTGTGGACGGCCCTGCTCATCACATGCCACCAGATCTACATGCACCTGCG  209
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GCCCAGGCCATCTCCGGCTTCTTTGTGTGGACAGCTCTGCTCATCACTTGCCACCAGATCTACATGCATCTGCG  296

Query  210  CTGCTACAGCTGCCCCAACGAGCAGCGCTACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTTGACT  283
            ||||||||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  CTGCTACAGCCGTCCCAATGAGCAGCGCCACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTCGACT  370

Query  284  CCTGGCTCAGCCTCCTCTTCTTCACCAACGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGCGACTGCTATGAG  357
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CCTGGCTCAGCCTCCTCTTCTTCACCAATGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGAGACTGCTATGAG  444

Query  358  GCCTTGGTCATCTATAATTTCCTGAGCCTGTGCTATGAGTACCTAGGAGGAGAAAGTTCCATCATGTCGGAGAT  431
            |||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct  445  GCCTTTGTCATCTATAACTTCCTGAGCTTGTGCTATGAGTACCTCGGGGGAGAGAGTGCCATCATGTCTGAGAT  518

Query  432  CAGAGGAAAACCCATTGAGTCCAGCTGTATGTATGGCACCTGCTGCCTCTGGGGAAAGACTTATTCCATCGGAT  505
            ||||||.||..||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  519  CAGAGGGAAGGCCATTGAGTCCAGCTGTATGTACGGCACGTGCTGCCTCTGGGGAAAGACCTACTCCATCGGAT  592

Query  506  TTCTGAGGTTCTGCAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCGGTCAGCACTGTGGTC  579
            |.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.
Sbjct  593  TCCTGCGGTTCTGTAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCCGTCAGCACCGTTATA  666

Query  580  CTCCAGGCCTTCGGCAAGTACCGGGATGGGGACTTTGACGTCACCAGTGGCTACCTCTACGTGACCATCATCTA  653
            |||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCCAGGCCTTTGGCAAGTACCGGGACGGAGACTTTGATGTCACCAGTGGGTACCTCTACGTGACCATCATCTA  740

Query  654  CAACATCTCCGTCAGCCTGGCCCTCTACGCCCTCTTCCTCTTCTACTTCGCCACCCGGGAGCTGCTCAGCCCCT  727
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACATCTCCGTCAGCCTGGCCCTATATGCGCTCTTCCTCTTCTACTTTGCCACAAGGGAGCTGCTCAGCCCCT  814

Query  728  ACAGCCCCGTCCTCAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATCTTTCTTTCCTTCTGGCAAGGCATGCTCCTGGCC  801
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  ACAGCCCTGTCCTCAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATATTCCTCTCCTTCTGGCAAGGCATGCTGCTGGCC  888

Query  802  ATCCTGGAGAAGTGTGGGGCCATCCCCAAAATCCACTCGGCCCGCGTGTCGGTGGGCGAGGGCACCGTGGCTGC  875
            |||.|.||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCTTAGAGAAGTGCGGGGCCATCCCCAAGATCAACTCAGCGCGAGTGTCAGTGGGTGAGGGCACCGTGGCTGC  962

Query  876  CGGCTACCAGGACTTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTTGCAGCCCTGGCCCTGCGGCACGCCTTCACCTACA  949
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CGGCTACCAGGACTTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTCGCGGCCTTGGCCCTGCGGCATGCCTTCACCTACA  1036

Query  950  AGGTCTATGCTGACAAGAGGCTGGACGCACAAGGCCGCTGTGCCCCCATGAAGAGCATCTCCAGCAGCCTCAAG  1023
            |||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  AGGTCTACGCTGACAAGAGACTGGACGCTCAAGGCCGCTGCGCCCCCATGAAGAGCATCTCCAGCAGCCTCAAA  1110

Query 1024  GAGACCATGAACCCGCACGACATCGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCACCTGCCTACCAGCAGTACACGCA  1097
            ||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGACCATGAACCCACACGATATTGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCGCCAGCCTACCAGCAGTACACGCA  1184

Query 1098  GCAGTCCACCCTGGAGCCTGGGCCCACCTGGCGTGGTGGCGCCCACGGCCTCTCCCGCTCCCACAGCCTCAGTG  1171
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||.||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  GCAGTCCACTCTGGAGCCCGGGCCCACCTGGCGTGGCGGCACGCACAGCCTTTCCCGCTCCCACAGCCTTAGTG  1258

Query 1172  GCGCCCGCGACAACGAGAAGACTCTCCTGCTCAGCTCTGATGATGAATTC  1221
            |.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  GTGCACGCGACAATGAGAAGACTCTGCTGCTCAGCTCTGATGATGAGTTC  1308