Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02878
• Subject: XM_011533561.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 978
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74

Query   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148

Query  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222

Query  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296

Query  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370

Query  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444

Query  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518

Query  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592

Query  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666

Query  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740

Query  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814

Query  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAA------  882

Query  889  GTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAGTCACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGGC  962
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query  963  CAGCTCCATGGGGAATCTGCCAGAAGTGGACTTCCCTGTCCCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTGC  1036
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query 1037  AGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACTGACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCTG  1110
                                                                                      
Sbjct  883  --------------------------------------------------------------------------  882

Query 1111  GATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  1184
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  ---------------ACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTCT  941

Query 1185  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  978