Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02880
- Subject:
- NM_173749.4
- Aligned Length:
- 2212
- Identities:
- 1864
- Gaps:
- 53
Alignment
Query 1 ATGGAGCTGGGTTGCTGGACGCAGTTGGGGCTCACTTTTCTTCAGCTCCTTCTCATCTCGTCCTTGCCAAGAGA 74
||||||||.|...|.|||.|||||||||||||....||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTAGACAGATGGGCGCAGTTGGGGCTGGTGTTCCTGCAGCTCCTTCTCATCTCATCGTTGCCAAGAGA 74
Query 75 GTACACAGTCATTAATGAAGCCTGCCCTGGAGCAGAGTGGAATATCATGTGTCGGGAGTGCTGTGAATATGATC 148
||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 GTACACGGTCATTAATGAAGCCTGTCCCGGAGCTGAGTGGAACATCATGTGTAGAGAATGTTGTGAATATGATC 148
Query 149 AGATTGAGTGCGTCTGCCCCGGAAAGAGGGAAGTCGTGGGTTATACCATCCCTTGCTGCAGGAATGAGGAGAAT 222
|||||||.|||.|||||||.|||||||.||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 AGATTGAATGCCTCTGCCCAGGAAAGAAGGAAGTGGTGGGTTACACCATCCCATGCTGCAGGAATGAGGATAAT 222
Query 223 GAGTGTGACTCCTGCCTGATCCACCCAGGTTGTACCATCTTTGAAAACTGCAAGAGCTGCCGAAATGGCTCATG 296
||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 GAATGTGACTCCTGTCTAATTCACCCAGGTTGTACCATCTTTGAAAACTGCAAGAGCTGCCGCAATGGCTCCTG 296
Query 297 GGGGGGTACCTTGGATGACTTCTATGTGAAGGGGTTCTACTGTGCAGAGTGCCGAGCAGGCTGGTACGGAGGAG 370
|||.||.||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGCGGAACTCTGGATGACTTCTACGTGAAGGGATTCTACTGCGCAGAGTGCAGGGCAGGCTGGTACGGAGGAG 370
Query 371 ACTGCATGCGATGTGGCCAGGTTCTGCGAGCCCCAAAGGGTCAGATTTTGTTGGAAAGCTATCCCCTAAATGCT 444
|||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||
Sbjct 371 ACTGCATGCGATGTGGCCAGGTTCTTCGAGCCTCAAAGGGTCAGATCTTGTTGGAGAGCTATCCCTTAAACGCT 444
Query 445 CACTGTGAATGGACCATTCATGCTAAACCTGGGTTTGTCATCCAACTAAGATTTGTCATGTTGAGCCTGGAGTT 518
||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||.|||||||..|.||.||||..|||.|||||||.|||||
Sbjct 445 CACTGTGAATGGACTATTCATGCCAGACCTGGGTTTATCATCCAGTTGAGGTTTGGTATGCTGAGCCTAGAGTT 518
Query 519 TGACTACATGTGCCAGTATGACTATGTTGAGGTTCGTGATGGAGACAACCGCGATGGCCAGATCATCAAGCGTG 592
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|.||..|||..||||||||||||.
Sbjct 519 TGACTACATGTGCCAATATGACTATGTGGAGGTCCGCGATGGGGATAATAGTGACAGCCCTATCATCAAGCGTT 592
Query 593 TCTGTGGCAACGAGCGGCCAGCTCCTATCCAGAGCATAGGATCCTCACTCCACGTCCTCTTCCACTCCGATGGC 666
||||||||||||||.||||||||||.|||..|||||..||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 593 TCTGTGGCAACGAGAGGCCAGCTCCCATCAGGAGCACTGGCTCTTCACTCCATGTCCTTTTCCATTCTGATGGC 666
Query 667 TCCAAGAATTTTGACGGTTTCCATGCCATTTATGAGGAGATCACAGCATGCTCCTCATCCCCTTGTTTCCATGA 740
||||||||.||.||.||.|||||.||..|.|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCAAGAACTTCGATGGCTTCCACGCTGTCTTTGAGGAGATCACAGCGTGCTCCTCATCCCCTTGTTTCCATGA 740
Query 741 CGGCACGTGCGTCCTTGACAAGGCTGGATCTTACAAGTGTGCCTGCTTGGCAGGCTATACTGGGCAGCGCTGTG 814
.|||||.|||.|||||||||...||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGCACATGCCTCCTTGACACCACTGGGTCTTTCAAGTGTGCCTGCCTGGCTGGCTACACTGGGCAGCGCTGTG 814
Query 815 AAAATCTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCGTCAGAAGATTCATTGTCTGTCCTTGAAGAAAGAAAC 888
|||||| |.|||||||||||||||
Sbjct 815 AAAATC---------------------------------------------------TACTTGAAGAAAGAAAC 837
Query 889 TGCTCAGACCCTGGGGGCCCAGTCAATGGGTACCAGAAAATAACAGGGGGCCCTGGGCTTATCAACGGACGCCA 962
||||||||||.||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||..||.|||||.|||.||||.|..|||||
Sbjct 838 TGCTCAGACCTTGGGGGGCCAGTCAATGGGTACAAGAAAATCACAGAAGGTCCTGGACTTCTCAATGAGCGCCA 911
Query 963 TGCTAAAATTGGCACCGTGGTGTCTTTCTTTTGTAACAACTCCTATGTTCTTAGTGGCAATGAGAAAAGAACTT 1036
||..|||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 912 TGTAAAAATTGGCACGGTTGTGTCTTTCTTTTGTAACGGCTCATACGTTCTGAGTGGCAATGAGAAACGAACTT 985
Query 1037 GCCAGCAGAATGGAGAGTGGTCAGGGAAACAGCCCATCTGCATAAAAGCCTGCCGAGAACCAAAGATTTCAGAC 1110
|||||||||||||||||||||||||.||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 986 GCCAGCAGAATGGAGAGTGGTCAGGAAAGCAACCTGTCTGCATGAAAGCCTGCCGGGAACCGAAGATCTCAGAC 1059
Query 1111 CTGGTGAGAAGGAGAGTTCTTCCGATGCAGGTTCAGTCAAGGGAGACACCATTACACCAGCTATACTCAGCGGC 1184
|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||||
Sbjct 1060 CTGGTGAGAAGGAGAGTCCTTTCGATGCAGGTTCAGTCAAGGGAGACACCATTACATCAGCTTTATTCCACGGC 1133
Query 1185 CTTCAGCAAGCAGAAACTGCAGAGTGCCCCTACCAAGAAGCCAGCCCTTCCCTTTGGAGATCTGCCCATGGGAT 1258
.|||||||||||||||.|||||..||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||...||||
Sbjct 1134 TTTCAGCAAGCAGAAATTGCAGGATGCCTCTACCAAAAAGCCAGCCCTTCCATTTGGAGACCTGCCCCCTGGAT 1207
Query 1259 ACCAACATCTGCATACCCAGCTCCAGTATGAGTGCATCTCACCCTTCTACCGCCGCCTGGGCAGCAGCAGGAGG 1332
|||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1208 ACCAACATCTGCACACCCAAGTCCAGTATGAGTGCATCTCGCCCTTCTACCGCCGCCTGGGAAGCAGCAGGAGG 1281
Query 1333 ACATGTCTGAGGACTGGGAAGTGGAGTGGGCGGGCACCATCCTGCATCCCTATCTGCGGGAAAATTGAGAACA- 1405
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||.||
Sbjct 1282 ACATGCCTGAGAACTGGGAAGTGGAGTGGGCGGGCCCCGTCCTGTATCCCAATCTGTGGAAAAATCGAGAGCAC 1355
Query 1406 TCACTGCTCCAAAGACCCAAGGGTTGCGCTGGCCGTGGCAGGCAGCCATCTACAGGAGGACCAGCGGGGTGCAT 1479
|| ||.||||||||||||||||....||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1356 TC-CTTCTCCAAAGACCCAAGGCACCCGCTGGCCATGGCAGGCAGCCATCTACCGGAGGACCAGTGGTGTACAC 1428
Query 1480 GACGGCAGCCTACACAAGGGAGCGTGGTTCCTAGTCTGCAGCGGTGCCCTGGTGAATGAGCGCACTGTGGTGGT 1553
||.||..|.||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1429 GATGGTGGTCTGCACAAAGGTGCATGGTTCTTGGTCTGCAGTGGTGCCCTGGTGAATGAACGGACTGTGGTTGT 1502
Query 1554 GGCTGCCCACTGTGTTACTGACCTGGGGAAGGTCACCATGATCAAGACAGCAGACCTGAAAGTTGTTTTGGGGA 1627
|||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1503 GGCTGCCCACTGTGTGACTGAGCTGGGGAAGGCCACCATCATCAAGACAGCAGACCTCAAGGTTGTCTTGGGAA 1576
Query 1628 AATTCTACCGGGATGATGACCGGGATGAGAAGACCATCCAGAGCCTACAGATTTCTGCTATCATTCTGCATCCC 1701
||||||||.||||.|||||.|||||||||||||.||||||||...|||.|.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1577 AATTCTACAGGGACGATGATCGGGATGAGAAGAGCATCCAGAATTTACGGGTTTCTGCTATCATTCTGCACCCC 1650
Query 1702 AACTATGACCCCATCCTGCTTGATGCTGACATCGCCATCCTGAAGCTCCTAGACAAGGCCCGTATCAGCACCCG 1775
|||||||||||.|||||||||||..||||||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 1651 AACTATGACCCTATCCTGCTTGACACTGACATCGCTGTTCTGAAGCTCCTAGACAAAGCTCGCATCAGTACCCG 1724
Query 1776 AGTCCAGCCCATCTGCCTCGCTGCCAGTCGGGATCTCAGCACTTCCTTCCAGGAGTCCCACATCACTGTGGCTG 1849
.|||||.|||||||||||.|||.|||.||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1725 TGTCCAACCCATCTGCCTGGCTACCACTCGGGACCTCAGCACCTCTTTCCAGGAATCCCACATCACTGTGGCTG 1798
Query 1850 GCTGGAATGTCCTGGCAGACGTGAGGAGCCCTGGCTTCAAGAACGACACACTGCGCTCTGGGGTGGTCAGTGTG 1923
|||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||..|.|..|.|||..|||||||.|||
Sbjct 1799 GCTGGAACATCCTGGCAGATGTGAGGAGCCCTGGCTTTAAGAATGATACCTTACATTATGGAATGGTCAGAGTG 1872
Query 1924 GTGGACTCGCTGCTGTGTGAGGAGCAGCATGAGGACCATGGCATCCCAGTGAGTGTCACTGATAACATGTTCTG 1997
||.|||.|..||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1873 GTAGACCCAATGCTTTGTGAGGAACAGCATGAAGACCATGGCATTCCAGTTAGTGTCACTGACAACATGTTCTG 1946
Query 1998 TGCCAGCTGGGAACCCACTGCCCCTTCTGATATCTGCACTGCAGAGACAGGAGGCATCGCGGCTGTGTCCTTCC 2071
|||||||...||.||||.|.||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1947 TGCCAGCAAAGATCCCAGTACCCCTTCTGACATCTGCACTGCAGAGACAGGGGGCATCGCTGCTTTGTCCTTCC 2020
Query 2072 CGGGACGAGCATCTCCTGAGCCACGCTGGCATCTGATGGGACTGGTCAGCTGGAGCTATGATAAAACATGCAGC 2145
|.||.||||||||.||.|||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2021 CAGGCCGAGCATCCCCCGAGCCACGCTGGCATTTGGTGGGGCTGGTCAGCTGGAGCTATGACAAGACATGTAGC 2094
Query 2146 CACAGGCTCTCCACTGCCTTCACCAAGGTGCTGCCTTTTAAAGACTGGATTGAAAGAAATATGAAA 2211
.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2095 AATGGCCTATCCACAGCCTTCACAAAGGTGTTGCCGTTCAAAGACTGGATTGAGAGAAACATGAAA 2160