Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02891
- Subject:
- NM_001039509.1
- Aligned Length:
- 1178
- Identities:
- 937
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGGCTTGGCAGGGCTGGC--CCGCGGCG-----TGGCAGTGGGTCGCCGGCTGCTGGC-TCCTCCTCG---TC 63
||||| |||.|.|.|.|| |..||||| .|||.|.|||.||.....|||..|| ||||||..| ||
Sbjct 1 ATGGC--GGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGGGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCTCCGGGGGATC 72
Query 64 CTTGTCCTCGTCCTACTTGTGAGCCCCCGC------GGCTGCC-------------GAGCGCGGCGGGGCCTCC 118
|| ||| || |||||.|.|| ||||.|| ||||.|.||.|.|||.|.
Sbjct 73 CT----CTC--------TG-GAGCCACAGCTAACAAGGCTTCCCAGAACAGGACCAGAGCACTGCAGAGCCACA 133
Query 119 GCGGTC-------TGCTCATGGCGCACAGCCAGCG-GCTGCTCTTCC--------GAAT--------------- 161
|| || || ||.||.| .|||| || ||..||||.|| ||||
Sbjct 134 GC--TCACCAGAATG--CAAGGAG--GAGCC--CGAGCCCCTCTCCCCTGAGCTAGAATACATTCCCAGAAAGA 199
Query 162 ----------------------------------CGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGCTCGGGTACCTC 201
|.||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 200 GGGGCAAGAACCCCATGAAAGCCGTGGGGCTAGCCTGGTATAGCCTGTACACCCGAACCTGGCTTGGGTACCTC 273
Query 202 TTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAGCCCCGCCTCTT 275
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 274 TTCTACCGACAGCAGCTTCGGAGGGCTCGGAATCGCTATCCCAAAGGCCACTCCAAAACTCAGCCCCGCCTCTT 347
Query 276 CAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCCC 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 348 CAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCTG 421
Query 350 AGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAGGGGTCACCTTG 423
.||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|.||||
Sbjct 422 GGCTGGCAGTGGCTGTGGACCCCTCAGACCCGAGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAAGAGTTAACTTG 495
Query 424 GTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACCGGGA 497
||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 496 GTTGCCATTCTCTGCACCCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACAGGGA 569
Query 498 CTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCA 571
||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 CTGTCGAGTGTATGGGAGCCCTCAGGATGGTATCCCCTACCTCACCCACCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCA 643
Query 572 GCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCTACCTACTGGAT 645
||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 644 GCGTGGGACGACTTCAGATTCGAGCCCTAGCCACCCCTGGCCACACTCAAGGCCATCTGGTCTACCTGCTGGAT 717
Query 646 GGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGGCGGACCTT 719
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 718 GGGGAGCCCTACAAAGGTCCTTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGACGGACCTT 791
Query 720 TGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACACCCTTCTGTGGC 793
.||.||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|..||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 792 CGAAGGCACAGCGGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGTTAGACCTGGGGGATGACACCCTGCTGTGGC 865
Query 794 CTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGGCCCGGGAGAGG 867
||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||
Sbjct 866 CTGGGCATGAATACGCAGAAGAGAACCTGGGCTTTGCAGGCGTGGTGGAGCCCGAGAACTTGGCTCGTGAGAGG 939
Query 868 AAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGAGAGGAGCGCTC 941
||||||||||||||.|||.||||.|||.||||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 940 AAGATGCAGTGGGTACAGAGGCAACGGATGGAACGCAAGAGCACATGCCCATCCACCCTGGGAGAGGAACGCGC 1013
Query 942 CTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGGCCCCACTGGGG 1015
|||||||||.||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|
Sbjct 1014 CTACAACCCATTCCTGAGAACCCATTGCCTGGAACTACAGGAGGCTCTGGGGCCAGGGCCAGGCCCCACCAGTG 1087
Query 1016 ATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGAGCAAG 1083
||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1088 ATGACGGCTGCTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAGGAGCTGCGCCGCCTGAAGGACATGCATAAAAGCAAG 1155