Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02891
Subject:
NM_001039509.1
Aligned Length:
1178
Identities:
937
Gaps:
118

Alignment

Query    1  ATGGCTTGGCAGGGCTGGC--CCGCGGCG-----TGGCAGTGGGTCGCCGGCTGCTGGC-TCCTCCTCG---TC  63
            |||||  |||.|.|.|.||  |..|||||     .|||.|.|||.||.....|||..|| ||||||..|   ||
Sbjct    1  ATGGC--GGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGGGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCTCCGGGGGATC  72

Query   64  CTTGTCCTCGTCCTACTTGTGAGCCCCCGC------GGCTGCC-------------GAGCGCGGCGGGGCCTCC  118
            ||    |||        || |||||.|.||      ||||.||             ||||.|.||.|.|||.|.
Sbjct   73  CT----CTC--------TG-GAGCCACAGCTAACAAGGCTTCCCAGAACAGGACCAGAGCACTGCAGAGCCACA  133

Query  119  GCGGTC-------TGCTCATGGCGCACAGCCAGCG-GCTGCTCTTCC--------GAAT---------------  161
            ||  ||       ||  ||.||.|  .||||  || ||..||||.||        ||||               
Sbjct  134  GC--TCACCAGAATG--CAAGGAG--GAGCC--CGAGCCCCTCTCCCCTGAGCTAGAATACATTCCCAGAAAGA  199

Query  162  ----------------------------------CGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGCTCGGGTACCTC  201
                                              |.||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  200  GGGGCAAGAACCCCATGAAAGCCGTGGGGCTAGCCTGGTATAGCCTGTACACCCGAACCTGGCTTGGGTACCTC  273

Query  202  TTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAGCCCCGCCTCTT  275
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  274  TTCTACCGACAGCAGCTTCGGAGGGCTCGGAATCGCTATCCCAAAGGCCACTCCAAAACTCAGCCCCGCCTCTT  347

Query  276  CAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCCC  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  348  CAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCTG  421

Query  350  AGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAGGGGTCACCTTG  423
            .||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|.||||
Sbjct  422  GGCTGGCAGTGGCTGTGGACCCCTCAGACCCGAGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAAGAGTTAACTTG  495

Query  424  GTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACCGGGA  497
            ||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  496  GTTGCCATTCTCTGCACCCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACAGGGA  569

Query  498  CTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCA  571
            ||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  CTGTCGAGTGTATGGGAGCCCTCAGGATGGTATCCCCTACCTCACCCACCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCA  643

Query  572  GCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCTACCTACTGGAT  645
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  644  GCGTGGGACGACTTCAGATTCGAGCCCTAGCCACCCCTGGCCACACTCAAGGCCATCTGGTCTACCTGCTGGAT  717

Query  646  GGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGGCGGACCTT  719
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  718  GGGGAGCCCTACAAAGGTCCTTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGACGGACCTT  791

Query  720  TGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACACCCTTCTGTGGC  793
            .||.||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|..||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  792  CGAAGGCACAGCGGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGTTAGACCTGGGGGATGACACCCTGCTGTGGC  865

Query  794  CTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGGCCCGGGAGAGG  867
            ||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  866  CTGGGCATGAATACGCAGAAGAGAACCTGGGCTTTGCAGGCGTGGTGGAGCCCGAGAACTTGGCTCGTGAGAGG  939

Query  868  AAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGAGAGGAGCGCTC  941
            ||||||||||||||.|||.||||.|||.||||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct  940  AAGATGCAGTGGGTACAGAGGCAACGGATGGAACGCAAGAGCACATGCCCATCCACCCTGGGAGAGGAACGCGC  1013

Query  942  CTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGGCCCCACTGGGG  1015
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|
Sbjct 1014  CTACAACCCATTCCTGAGAACCCATTGCCTGGAACTACAGGAGGCTCTGGGGCCAGGGCCAGGCCCCACCAGTG  1087

Query 1016  ATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGAGCAAG  1083
            ||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1088  ATGACGGCTGCTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAGGAGCTGCGCCGCCTGAAGGACATGCATAAAAGCAAG  1155