Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02891
- Subject:
- NM_015488.5
- Aligned Length:
- 1189
- Identities:
- 1022
- Gaps:
- 140
Alignment
Query 1 ATGGCTTGGC-----------------------AGGGCTG-------------GCCCGCGGCGTGGCAGTGGG- 37
||||| ||| |||||.| |||||||.|.| |.|.|||
Sbjct 1 ATGGC--GGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGGGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCT--CCGGGGGA 70
Query 38 ---TCGCCGG-----CTGCT-----GGCTCCTC----CTCGTCCTTGTCCTCGTCCTACTTGTGAGCCC----- 89
||||.|| |.||| ||||.||| |..|.|| .|.||||
Sbjct 71 TTCTCGCAGGAGCCACAGCTAACAAGGCTTCTCATAACAGGACC------------------CGGGCCCTGCAA 126
Query 90 --CCGCGGCTGCC--GAGCGC--GGCGGGGCC----------TCCGCGGTCTGCT------CAT---------- 131
||.|.|||.|| |||.|| ||.||..|| |||.||| .||| |||
Sbjct 127 AGCCACAGCTCCCCAGAGGGCAAGGAGGAACCTGAACCCCTATCCCCGG--AGCTGGAATACATTCCCAGAAAG 198
Query 132 -GGCGCACAG----CCA----------GCGGCTGCTCTTCCGAATCGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGC 190
||.||| || ||| |.|.|||..|| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 AGGGGCA-AGAACCCCATGAAAGCTGTGGGACTGGCCT---------GGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGC 262
Query 191 TCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAG 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 TCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAG 336
Query 265 CCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGA 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 CCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGA 410
Query 339 CACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAG 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 CACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAG 484
Query 413 GGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGG 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 GGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGG 558
Query 487 CGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCA 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCA 632
Query 561 AGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCT 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 AGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCT 706
Query 635 ACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGT 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 ACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGT 780
Query 709 GGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACAC 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACAC 854
Query 783 CCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGG 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 CCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGG 928
Query 857 CCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGA 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 CCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGA 1002
Query 931 GAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGG 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 GAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGG 1076
Query 1005 CCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGA 1150
Query 1079 GCAAG 1083
|||||
Sbjct 1151 GCAAG 1155