Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02891
Subject:
XM_006496167.3
Aligned Length:
1219
Identities:
940
Gaps:
161

Alignment

Query    1  ----------------------ATGGCTTGGCAGGGCTGGCC---CGCGGC---GTGGCAG---TGGGTCGCCG  43
                                  |   |||..|.||||   ||   |||..|   |.|.|||   ||.| ||.||
Sbjct    1  ATGCGGCGAAAGCTACCGATCCA---CTTCTCTGGGC---CCAAACGCCTCCCAGAGTCAGCTCTGCG-CGACG  67

Query   44  GCTGCTG-------GCTCCTCCTCGTCCTTG--------------TCCTCGTCCTACTTGTGAGCCCCCGC---  93
            .| ||.|       ||.|||||||  ||..|              ||||| ||     || |||||.|.||   
Sbjct   68  AC-GCGGAACTCGAGCCCCTCCTC--CCGGGAGGAAGTAGGCGGATCCTC-TC-----TG-GAGCCACAGCTAA  131

Query   94  ---GGCTGCC-------------GAGCGCGGCGGGGCCTCCGCGGTC-------TGCTCATGGCGCACAGCCAG  144
               ||||.||             ||||.|.||.|.|||.|.||  ||       ||  ||.||.|  .||||  
Sbjct  132  CAAGGCTTCCCAGAACAGGACCAGAGCACTGCAGAGCCACAGC--TCACCAGAATG--CAAGGAG--GAGCC--  197

Query  145  CG-GCTGCTCTTCC--------GAAT------------------------------------------------  161
            || ||..||||.||        ||||                                                
Sbjct  198  CGAGCCCCTCTCCCCTGAGCTAGAATACATTCCCAGAAAGAGGGGCAAGAACCCCATGAAAGCCGTGGGGCTAG  271

Query  162  -CGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGCTCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAAT  234
             |.||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  272  CCTGGTATAGCCTGTACACCCGAACCTGGCTTGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTTCGGAGGGCTCGGAAT  345

Query  235  CGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCT  308
            |||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  CGCTATCCCAAAGGCCACTCCAAAACTCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCT  419

Query  309  CTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTC  382
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||||||||||||||.||||||||..
Sbjct  420  CTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCTGGGCTGGCAGTGGCTGTGGACCCCTCAGACCCGA  493

Query  383  GGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAGGGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGAC  456
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|.||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  494  GGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAAGAGTTAACTTGGTTGCCATTCTCTGCACCCACAAGCACTGGGAC  567

Query  457  CACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCAT  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  568  CACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACAGGGACTGTCGAGTGTATGGGAGCCCTCAGGATGGTAT  641

Query  531  CCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTA  604
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct  642  CCCCTACCTCACCCACCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGACTTCAGATTCGAGCCCTAGCCA  715

Query  605  CACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCTACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTC  678
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  716  CCCCTGGCCACACTCAAGGCCATCTGGTCTACCTGCTGGATGGGGAGCCCTACAAAGGTCCTTCCTGCCTCTTC  789

Query  679  TCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACT  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||..||.||||||||||||||||||||
Sbjct  790  TCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGACGGACCTTCGAAGGCACAGCGGAGACCATGCTGAGCTCACT  863

Query  753  GGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACACCCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCT  826
            ||||||||||.|.|..||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  864  GGACACTGTGTTAGACCTGGGGGATGACACCCTGCTGTGGCCTGGGCATGAATACGCAGAAGAGAACCTGGGCT  937

Query  827  TTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGGCCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAG  900
            |||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||.||||.
Sbjct  938  TTGCAGGCGTGGTGGAGCCCGAGAACTTGGCTCGTGAGAGGAAGATGCAGTGGGTACAGAGGCAACGGATGGAA  1011

Query  901  CGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGAGAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGC  974
            ||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1012  CGCAAGAGCACATGCCCATCCACCCTGGGAGAGGAACGCGCCTACAACCCATTCCTGAGAACCCATTGCCTGGA  1085

Query  975  GCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGGCCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAG  1048
            .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1086  ACTACAGGAGGCTCTGGGGCCAGGGCCAGGCCCCACCAGTGATGACGGCTGCTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAGG  1159

Query 1049  AGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGAGCAAG  1083
            ||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1160  AGCTGCGCCGCCTGAAGGACATGCATAAAAGCAAG  1194