Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02891
- Subject:
- XM_006496167.3
- Aligned Length:
- 1219
- Identities:
- 940
- Gaps:
- 161
Alignment
Query 1 ----------------------ATGGCTTGGCAGGGCTGGCC---CGCGGC---GTGGCAG---TGGGTCGCCG 43
| |||..|.|||| || |||..| |.|.||| ||.| ||.||
Sbjct 1 ATGCGGCGAAAGCTACCGATCCA---CTTCTCTGGGC---CCAAACGCCTCCCAGAGTCAGCTCTGCG-CGACG 67
Query 44 GCTGCTG-------GCTCCTCCTCGTCCTTG--------------TCCTCGTCCTACTTGTGAGCCCCCGC--- 93
.| ||.| ||.||||||| ||..| ||||| || || |||||.|.||
Sbjct 68 AC-GCGGAACTCGAGCCCCTCCTC--CCGGGAGGAAGTAGGCGGATCCTC-TC-----TG-GAGCCACAGCTAA 131
Query 94 ---GGCTGCC-------------GAGCGCGGCGGGGCCTCCGCGGTC-------TGCTCATGGCGCACAGCCAG 144
||||.|| ||||.|.||.|.|||.|.|| || || ||.||.| .||||
Sbjct 132 CAAGGCTTCCCAGAACAGGACCAGAGCACTGCAGAGCCACAGC--TCACCAGAATG--CAAGGAG--GAGCC-- 197
Query 145 CG-GCTGCTCTTCC--------GAAT------------------------------------------------ 161
|| ||..||||.|| ||||
Sbjct 198 CGAGCCCCTCTCCCCTGAGCTAGAATACATTCCCAGAAAGAGGGGCAAGAACCCCATGAAAGCCGTGGGGCTAG 271
Query 162 -CGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGCTCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAAT 234
|.||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 272 CCTGGTATAGCCTGTACACCCGAACCTGGCTTGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTTCGGAGGGCTCGGAAT 345
Query 235 CGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCT 308
|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 CGCTATCCCAAAGGCCACTCCAAAACTCAGCCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCT 419
Query 309 CTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTC 382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||||||||||||||.||||||||..
Sbjct 420 CTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGACACCCAGGCTGGGCTGGCAGTGGCTGTGGACCCCTCAGACCCGA 493
Query 383 GGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAGGGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGAC 456
|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|.||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 494 GGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAAGAGTTAACTTGGTTGCCATTCTCTGCACCCACAAGCACTGGGAC 567
Query 457 CACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCAT 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 568 CACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGGCGGCACAGGGACTGTCGAGTGTATGGGAGCCCTCAGGATGGTAT 641
Query 531 CCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTA 604
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 642 CCCCTACCTCACCCACCCCCTGTGTCATCAAGATGTGGTCAGCGTGGGACGACTTCAGATTCGAGCCCTAGCCA 715
Query 605 CACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCTACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTC 678
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 716 CCCCTGGCCACACTCAAGGCCATCTGGTCTACCTGCTGGATGGGGAGCCCTACAAAGGTCCTTCCTGCCTCTTC 789
Query 679 TCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACT 752
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||..||.||||||||||||||||||||
Sbjct 790 TCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGTGGACGGACCTTCGAAGGCACAGCGGAGACCATGCTGAGCTCACT 863
Query 753 GGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACACCCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCT 826
||||||||||.|.|..||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 864 GGACACTGTGTTAGACCTGGGGGATGACACCCTGCTGTGGCCTGGGCATGAATACGCAGAAGAGAACCTGGGCT 937
Query 827 TTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGGCCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAG 900
|||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||.||||.
Sbjct 938 TTGCAGGCGTGGTGGAGCCCGAGAACTTGGCTCGTGAGAGGAAGATGCAGTGGGTACAGAGGCAACGGATGGAA 1011
Query 901 CGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGAGAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGC 974
||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1012 CGCAAGAGCACATGCCCATCCACCCTGGGAGAGGAACGCGCCTACAACCCATTCCTGAGAACCCATTGCCTGGA 1085
Query 975 GCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGGCCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAG 1048
.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1086 ACTACAGGAGGCTCTGGGGCCAGGGCCAGGCCCCACCAGTGATGACGGCTGCTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAGG 1159
Query 1049 AGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGAGCAAG 1083
||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1160 AGCTGCGCCGCCTGAAGGACATGCATAAAAGCAAG 1194