Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02921
- Subject:
- NM_001113565.1
- Aligned Length:
- 1224
- Identities:
- 1098
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC 74
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTGGGCACCTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGCTATTTGACGACGAATC 74
Query 75 GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG 148
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GGACCCTTTCGAGGTACTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCCG 148
Query 149 GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC 222
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||
Sbjct 149 GGGCCAAGAGCGCGGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCGGGCAAACAGTTGCGTAAAGAGTCC 222
Query 223 CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTCGGCGTGGCCGACAAAAAGGAGGAGACGCAGCCGCCGGT 296
Query 297 GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct 297 GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGGCGAGTTGGAAGAAGACCCGATCAACAACTACAGGGTGATGGGAAACTAA 370
Query 371 TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA 444
|||||||.|||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 TTGATAGGAGAGCAGAAAGGCGACCACCCCGTGAAAGAAGATTTGAAAAGCCACTTGAAGAAAAAGGTGAAGGA 444
Query 445 GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG 518
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 GGTGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATCGAACGGCCTATCCGAGGCCGAGGTGGTCTTGGAAGGGGTCGAGG 518
Query 519 GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG 592
.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGCGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAGCGTGAATTTGATAGGCATAGTG 592
Query 593 GAAGTGATAGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCAC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 593 GAAGTGATAGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCATGAGGACAAACGCGGAGGTAGCGGCTCTCAC 666
Query 667 AACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAACAGAGTCCCCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTACAG 740
||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 AACTGGGGAACTGTCAAAGATGAATTAAC--------------------------------------------- 695
Query 741 TGACTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAA 814
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 696 TGATTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAG---AGCACCCTGTGGCAGATACTGAAA 766
Query 815 ATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATT 888
||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 767 ATAAGGAGAACGAAGTTGAAGAGGTTAAGGAAGAGGGTCCAAAAGAGATGACTCTGGATGAGTGGAAAGCTATT 840
Query 889 CAAAATAAGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAA 962
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 841 CAAAATAAAGACCGAGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGCGCCGATGGACAATGGAAAAA 914
Query 963 GGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGA 1036
||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 GGGATTTGTTCTGCATAAATCAAAAAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCGGA 988
Query 1037 AGCCAGCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGG 1110
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 989 AGCCAGCAAATGATATAACATCTCAACTGGAGATCAATTTTGGAGACTTAGGCCGCCCAGGACGTGGTGGCAGA 1062
Query 1111 GGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGC 1184
||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1063 GGAGGACGTGGTGGGCGTGGGCGTGGTGGACGTCCAAACCGTGGCAGCAGGACTGATAAGTCAAGTGCTTCTGC 1136
Query 1185 TCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT 1224
|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1137 TCCTGATGTAGATGACCCAGAGGCCTTCCCAGCTCTGGCC 1176