Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02948
- Subject:
- NM_020593.2
- Aligned Length:
- 1413
- Identities:
- 1108
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCATGGAGACCGAGACGGCGCCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGATCCCCTGCTCCTCATCTT 74
|||||.|||.|.|||.|||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGCCGTAGAGGCCGAGACGGGGCTGCTGACCCTGGAGTCGCTGCCCACCGACCCTCTGCTGCTCATCTT 74
Query 75 ATCCTTTTTGGACTATCGGGATCTAATCAACTGTTGTTATGTCAGTCGAAGACTTAGCCAGCTATCAAGTCATG 148
||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 75 ATCCTTCGTGGACTACAGGGACCTAATCAATTGTTGCTATGTTAGTCGAAGACTTAGCCAGCTTTCAACTCATG 148
Query 149 ATCCGCTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAGAAAACACAGAAGAATCAGTGT 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|...|||||.||||||.
Sbjct 149 ATCCACTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAAAAAGCCGGGAAGAGTCAGTGC 222
Query 223 TGGAAATCTCTCTTCATAGATACTTACTCTGATGTAGGAAGATACATTGACCATTATGCTGCTATTAAAAAGGC 296
||||.|||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 223 TGGAGATCCCTCTTCATAGAGACCTACTCAGACGTGGGGAGGTACATCGACCATTACGCCGCCATTAAAAAGGC 296
Query 297 CTGGGATGATCTCAAGAAATATTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGTGCTCGAG 370
||||..|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 297 CTGGCGTGACCTCAAGAAGTACTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGCGCACGTG 370
Query 371 AGGAAGACCTCGATGCTGTGGAAGCGCAGATTGGCTGCAAGCTTCCTGACGATTATCGATGTTCATACCGAATT 444
||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 371 AGGAAGACCTGGATGCTGTCGAAGCTCAGATCGGTTGCAAGCTCCCGGATGATTATCGCTGTTCATACCGGATC 444
Query 445 CACAATGGACAGAAGTTAGTGGTTCCTGGGTTATTGGGAAGCATGGCACTGTCTAATCACTATCGTTCTGAAGA 518
|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 445 CACAACGGGCAAAAGTTAGTGGTGCCGGGGTTGCTGGGAAGTATGGCACTGTCCAATCACTACCGCTCTGAAGA 518
Query 519 TTTGTTAGACGTCGATACAGCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACTT 592
|.|..||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TCTACTAGATGTTGATACTGCTGCAGGAGGATTTCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACCT 592
Query 593 TTTGCATACATACTGGTTTGAGTCAGTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAATGAAGTTTTC 666
||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 593 TTTGCATACACACCGGCTTGAGTCAGTACATAGCTGTGGAGGCTGCAGAGGGGCGGAATAAGAACGAAGTGTTC 666
Query 667 TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATCCAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTACTGA 740
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 667 TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGGAATCCTGCTGCTATTGACATGTTTATCATAGGTGCTACTTTTACCGA 740
Query 741 CTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGTGGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATG 814
|||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 741 CTGGTTTACATCCTATGTCAACAATGTTGTATCAGGTGGTTTCCCCATCATCAGAGACCAGATTTTCAGATATA 814
Query 815 TTCACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGTGTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTT 888
||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 TTCATGATCCAGAATGTGTGGCAACAACTGGAGATATTACAGTTTCAGTGTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTC 888
Query 889 AGCTCTGTACATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAAAGATGCACTTCCTGA 962
||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 889 AGCTCTGTGCATCCGCCACACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAGGGATGCTCTTCCTGA 962
Query 963 GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTATTGGAGAATAACAAATGCTAAGGGTGACGTGGAAGAAGTTCAAGGAC 1036
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 963 GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTACTGGAGGATAACAAACGCTAAAGGGGATGTGGAAGAAGTCCAGGGAC 1036
Query 1037 CTGGAGTAGTTGGTGAATTTCCAATCATCAGCCCAGGTCGGGTATATGAATACACAAGCTGTACCACATTCTCT 1110
||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 CTGGAGTAGTCGGTGAATTTCCAATTATTAGCCCAGGTCGGATATATGAATACACAAGCTGTACCACATTTTCT 1110
Query 1111 ACAACATCAGGATACATGGAAGGATATTATACCTTCCATTTTCTTTACTTTAAAGACAAGATCTTTAATGTTGC 1184
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1111 ACAACATCAGGCTACATGGAAGGGTATTACACCTTCCATTTTCTGTACTTTAAGGACAAGGTCTTTAATGTTGC 1184
Query 1185 CATTCCCCGATTCCATATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCCCGATTGGAAATGGGTCCTGATGAAT 1258
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|| ||
Sbjct 1185 CATCCCCCGATTCCACATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCTCGATTGGTAA---GT---------- 1245
Query 1259 ATGAAGAGATGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGACGAGGATGATGATTCAGCAGATATGGATGAA 1332
Sbjct 1246 -------------------------------------------------------------------------- 1245
Query 1333 TCAGATGAAGATGATGAAGAGGAGAGACGGAGGAGAGTCTTTGATGTTCCCATTCGCAGACGCCGCTGCTCACG 1406
Sbjct 1246 -------------------------------------------------------------------------- 1245
Query 1407 CCTTTTT 1413
Sbjct 1246 ------- 1245