Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02948
- Subject:
- XM_017017533.2
- Aligned Length:
- 1413
- Identities:
- 927
- Gaps:
- 486
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCATGGAGACCGAGACGGCGCCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGATCCCCTGCTCCTCATCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATCCTTTTTGGACTATCGGGATCTAATCAACTGTTGTTATGTCAGTCGAAGACTTAGCCAGCTATCAAGTCATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATCCGCTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAGAAAACACAGAAGAATCAGTGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TGGAAATCTCTCTTCATAGATACTTACTCTGATGTAGGAAGATACATTGACCATTATGCTGCTATTAAAAAGGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTGGGATGATCTCAAGAAATATTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGTGCTCGAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGAAGACCTCGATGCTGTGGAAGCGCAGATTGGCTGCAAGCTTCCTGACGATTATCGATGTTCATACCGAATT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CACAATGGACAGAAGTTAGTGGTTCCTGGGTTATTGGGAAGCATGGCACTGTCTAATCACTATCGTTCTGAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGGCACTGTCTAATCACTATCGTTCTGAAGA 32
Query 519 TTTGTTAGACGTCGATACAGCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 TTTGTTAGACGTCGATACAGCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACTT 106
Query 593 TTTGCATACATACTGGTTTGAGTCAGTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAATGAAGTTTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 TTTGCATACATACTGGTTTGAGTCAGTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAATGAAGTTTTC 180
Query 667 TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATCCAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTACTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATCCAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTACTGA 254
Query 741 CTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGTGGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 CTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGTGGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATG 328
Query 815 TTCACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGTGTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 TTCACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGTGTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTT 402
Query 889 AGCTCTGTACATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAAAGATGCACTTCCTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 AGCTCTGTACATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAAAGATGCACTTCCTGA 476
Query 963 GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTATTGGAGAATAACAAATGCTAAGGGTGACGTGGAAGAAGTTCAAGGAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTATTGGAGAATAACAAATGCTAAGGGTGACGTGGAAGAAGTTCAAGGAC 550
Query 1037 CTGGAGTAGTTGGTGAATTTCCAATCATCAGCCCAGGTCGGGTATATGAATACACAAGCTGTACCACATTCTCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 CTGGAGTAGTTGGTGAATTTCCAATCATCAGCCCAGGTCGGGTATATGAATACACAAGCTGTACCACATTCTCT 624
Query 1111 ACAACATCAGGATACATGGAAGGATATTATACCTTCCATTTTCTTTACTTTAAAGACAAGATCTTTAATGTTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 ACAACATCAGGATACATGGAAGGATATTATACCTTCCATTTTCTTTACTTTAAAGACAAGATCTTTAATGTTGC 698
Query 1185 CATTCCCCGATTCCATATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCCCGATTGGAAATGGGTCCTGATGAAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 CATTCCCCGATTCCATATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCCCGATTGGAAATGGGTCCTGATGAAT 772
Query 1259 ATGAAGAGATGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGACGAGGATGATGATTCAGCAGATATGGATGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 ATGAAGAGATGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGACGAGGATGATGATTCAGCAGATATGGATGAA 846
Query 1333 TCAGATGAAGATGATGAAGAGGAGAGACGGAGGAGAGTCTTTGATGTTCCCATTCGCAGACGCCGCTGCTCACG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 TCAGATGAAGATGATGAAGAGGAGAGACGGAGGAGAGTCTTTGATGTTCCCATTCGCAGACGCCGCTGCTCACG 920
Query 1407 CCTTTTT 1413
|||||||
Sbjct 921 CCTTTTT 927