Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03014
- Subject:
- NM_001127397.2
- Aligned Length:
- 1449
- Identities:
- 1209
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT 74
Query 75 GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA 148
Query 149 CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA 222
Query 223 GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA 296
Query 297 TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG 370
Query 371 AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG 444
Query 445 TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC 518
Query 519 AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC 592
Query 593 CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA 666
Query 667 ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC 740
Query 741 TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC 814
Query 815 TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGA---------- 878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGAGGAAGATTTG 888
Query 879 -------------------------------------------------------------------------- 878
Sbjct 889 CAATCAACTAAAGAAGAGAGATTTCCAGCGATCCACAAGTCGATTGCTATTGGCTCTCAGCCAGTGCTCACTGT 962
Query 879 -------------------------------------------------------------------------- 878
Sbjct 963 TGGGACAACCCACATATCCAAATTGACAGATGACCAACTCATAAAAGAGTTTCTTAGTGGTTCTTACTGCTTTC 1036
Query 879 ----GGGTGTCGGTTGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGAT 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGGGGGTGTCGGTTGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGAT 1110
Query 949 AGTGGGAAAACCTCTGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGC 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTGGGAAAACCTCTGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGC 1184
Query 1023 TAGAGCTTATCATCTTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGAGCTTATCATCTTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAG-------------------------------- 1226
Query 1097 TTTGTGATATAACTGACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCT 1170
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 ----------------------------------------------GTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCT 1254
Query 1171 GTTACTGTATATATGCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGGTTGAATCTCCAGTGATCTGTAAAAT 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GTTACTGTATATATGCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGGTTGAATCTCCAGTGATCTGTAAAAT 1328
Query 1245 CTTAGATACAGCAGATGAAAATGGACTTCTTTCTCTCCCCAAC 1287
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CTTAGATACAGCAGATGAAAATGGACTTCTTTCTCTCCCCAAC 1371