Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03014
• Subject: XM_011532766.1
• Aligned Length: 1465
• Identities: 1237
• Gaps: 224

Alignment

Query    1  ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT  74

Query   75  GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA  148

Query  149  CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA  222

Query  223  GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA  296

Query  297  TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG  370

Query  371  AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG  444

Query  445  TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC  518

Query  519  AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC  592

Query  593  CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA  666

Query  667  ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC  740

Query  741  TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC  814

Query  815  TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGA----------  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  815  TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGAGGAAGATTTG  888

Query  879  --------------------------------------------------------------------------  878
                                                                                      
Sbjct  889  CAATCAACTAAAGAAGAGAGATTTCCAGCGATCCACAAGTCGATTGCTATTGGCTCTCAGCCAGTGCTCACTGT  962

Query  879  --------------------------------------------------------------------------  878
                                                                                      
Sbjct  963  TGGGACAACCCACATATCCAAATTGACAGATGACCAACTCATAAAAGAGTTTCTTAGTGGTTCTTACTGCTTTC  1036

Query  879  ----GGGTGTCGGTTGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGAT  948
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGGGGTGTCGGTTGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGAT  1110

Query  949  AGTGGGAAAACCTCTGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGC  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGGGAAAACCTCTGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGC  1184

Query 1023  TAGAGCTTATCATCTTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATA  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGAGCTTATCATCTTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATA  1258

Query 1097  TTTGTGATATAACTGACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCT  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTGTGATATAACTGACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCT  1332

Query 1171  GTTACTGTATATATGCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGG--GTTGAATCTCCAGTGATCTGTAAA  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ..|||||                 
Sbjct 1333  GTTACTGTATATATGCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGACTATGAAT-----------------  1389

Query 1243  ATCTTAGATACAGCAGATGAAAATGGACTTCTTTCTCTCCCCAAC--------------  1287
                               ||||.|||||          |.||||              
Sbjct 1390  -------------------AAAAGGGACT----------CTCAACAAACATTTGCTGAA  1419