Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03014
• Subject: XM_024452793.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1266
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT  74

Query   75  GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA  148

Query  149  CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA  222

Query  223  GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA  296

Query  297  TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG  370

Query  371  AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG  444

Query  445  TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC  518

Query  519  AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC  592

Query  593  CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA  666

Query  667  ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC  740

Query  741  TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC  814

Query  815  TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGAGGGTGTCGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGAGGGTGTCGGT  888

Query  889  TGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGATAGTGGGAAAACCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGATAGTGGGAAAACCTC  962

Query  963  TGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGCTAGAGCTTATCATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGCTAGAGCTTATCATC  1036

Query 1037  TTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATATTTGTGATATAACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATATTTGTGATATAACT  1110

Query 1111  GACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCTGTTACTGTATATAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCTGTTACTGTATATAT  1184

Query 1185  GCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGGTTGAATCTC--------------CAGTGATCT-GTAAAA  1243
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|.|||              .||||..|| |||.||
Sbjct 1185  GCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGGGTCTAGCTCTATCACCCACATTGGAGTGCACTGGTACAA  1258

Query 1244  TCTTAGAT-ACAGCAGATGAAA----ATGGACT-------TCTTTC--TCTC-----CCCAAC-----------  1287
            ||..||.| ||.||||....||    .|||.||       ||||.|  .|||     |||||.           
Sbjct 1259  TCACAGCTCACTGCAGCCTCAACTCTCTGGGCTCAAGCCATCTTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACC  1332

Query 1288  --------------------------------------------------------------------------  1287
                                                                                      
Sbjct 1333  ACAGGTGTGCACCACCATGCTTGGCTTCTTTTTTTTTTTTTCCTCTGGAGAGACAGGGTCTTACCATATTGCCC  1406

Query 1288  ----  1287
                
Sbjct 1407  AGAC  1410