Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03039
• Subject: XR_001755225.2
• Aligned Length: 3065
• Identities: 2247
• Gaps: 818

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGGGGAAGCTGCTAACCCGACCCGGATTGGCGCTGAGGTGGCCCGTGGGGCAGGGCAGATGATTCTGGACCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT  148

Query    1  -----------------ATGTCAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATA  57
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATA  222

Query   58  TGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGA  131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGA  296

Query  132  GTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGG  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGG  370

Query  206  AGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACC  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACC  444

Query  280  TGGGACAAGATTGCCGTCTCCCTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGG  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGGACAAGATTGCCGTCTCCCTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGG  518

Query  354  CATGAGGCCACAGCTGTGGATGCGGCTCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCG  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGAGGCCACAGCTGTGGATGCGGCTCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCG  592

Query  428  AGATTGTGAAGAACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAG------------------------------  471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  593  AGATTGTGAAGAACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGGTGTCACAAGGTCTTGTTATTGTGGG  666

Query  472  -----------------CAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCCCAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATG  528
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCCGATGGCTGCCTGACAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCCCAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATG  740

Query  529  GGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCTCCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTG  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCTCCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTG  814

Query  603  CCAGGGCACCGGCATGGTGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTG  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGGGCACCGGCATGGTGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTG  888

Query  677  CCATCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTGACCAGCGGGTC  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCATCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTGACCAGCGGGTC  962

Query  751  CTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCCAGGAGCATGACATTGAGCTGTCCCT  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCCAGGAGCATGACATTGAGCTGTCCCT  1036

Query  825  GATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGTGGACATCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACC  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGTGGACATCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACC  1110

Query  899  TGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCTGTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGAGGAAGAGCTG  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCTGTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGAGGAAGAGCTG  1184

Query  973  ATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTATCGGATATCCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCT  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTATCGGATATCCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCT  1258

Query 1047  GCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGGCCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACC  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGGCCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACC  1332

Query 1121  TGGCCTATCTCATTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCAGGTTGTTCGC  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGGCCTATCTCATTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCAGGTTGTTCGC  1406

Query 1195  CGCAGGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGGGAGGATGACCTGGAGGCACTCAAGGC  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCAGGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGGGAGGATGACCTGGAGGCACTCAAGGC  1480

Query 1269  CAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGGAAGCCATCCTGCGCGTGGCACGCCACTTCCAGT  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGGAAGCCATCCTGCGCGTGGCACGCCACTTCCAGT  1554

Query 1343  GCACAGACCCCAAAAACTGCAGCGTGGAGCTGACTCCAGACTATAGCATGGAGAGCCACCAGCGGGACCACGAG  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCACAGACCCCAAAAACTGCAGCGTGGAGCTGACTCCAGACTATAGCATGGAGAGCCACCAGCGGGACCACGAG  1628

Query 1417  AACTACGTGGCGTGCTCACGCAGCCACCGGCGCCGAGCCAAGGCCCTGCTGGACTTTGAGCGGCACGACGACGA  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AACTACGTGGCGTGCTCACGCAGCCACCGGCGCCGAGCCAAGGCCCTGCTGGACTTTGAGCGGCACGACGACGA  1702

Query 1491  CGAGCTGGGCTTCCGCAAGAACGACATCATCACAATCGTGTCTCAGAAGGACGAGCACTGCTGGGTGGGGGAGC  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGAGCTGGGCTTCCGCAAGAACGACATCATCACAATCGTGTCTCAGAAGGACGAGCACTGCTGGGTGGGGGAGC  1776

Query 1565  TCAACGGCCTGCGAGGCTGGTTTCCAGCCAAGTTCGTGGAAGTCCTGGATGAGCGCAGCAAAGAGTACTCCATC  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAACGGCCTGCGAGGCTGGTTTCCAGCCAAGTTCGTGGAAGTCCTGGATGAGCGCAGCAAAGAGTACTCCATC  1850

Query 1639  GCGGGGGATGACTCGGTGACGGAGGGGGTCACAGACCTCGTGCGAGGGACCCTCTGCCCGGCCCTTAAGGCCCT  1712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCGGGGGATGACTCGGTGACGGAGGGGGTCACAGACCTCGTGCGAGGGACCCTCTGCCCGGCCCTTAAGGCCCT  1924

Query 1713  GTTCGAACATGGACTGAAGAAGCCATCCCTGCTTGGGGGCGCCTGCCACCCCTGGCTGTTTATCGAGGAGGCTG  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTTCGAACATGGACTGAAGAAGCCATCCCTGCTTGGGGGCGCCTGCCACCCCTGGCTGTTTATCGAGGAGGCTG  1998

Query 1787  CAGGCCGGGAGGTCGAGAGAGACTTTGCCTCCGTGTATTCCCGTCTGGTGCTCTGTAAGACCT-----------  1849
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1999  CAGGCCGGGAGGTCGAGAGAGACTTTGCCTCCGTGTATTCCCGTCTGGTGCTCTGTAAGACCTTCAGGAGCTTT  2072

Query 1850  ---------TCAGGTTGGATGAAGATGGCAAAGTCCTGACCCCGGAGGAGCTGCTCTACCGGGCTGTGCAGTCT  1914
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGTGTCCCCTCAGGTTGGATGAAGATGGCAAAGTCCTGACCCCGGAGGAGCTGCTCTACCGGGCTGTGCAGTCT  2146

Query 1915  GTGAACGTGACCCACGATGCAGTGCATGCACAAATGGATGTGAAGCTCCGCTCACTGATCTGCGTGGGGCTCAA  1988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTGAACGTGACCCACGATGCAGTGCATGCACAAATGGATGTGAAGCTCCGCTCACTGATCTGCGTGGGGCTCAA  2220

Query 1989  --------------------------------------------------------------------------  1988
                                                                                      
Sbjct 2221  GTGAGTGTGGAAAAGGGGTTGGAGGAGAGCCCTGGAGTGGGGGGACCCAGCCCAGCATCAGGGGGGGTCCTTAC  2294

Query 1989  --------------------------------------------------------------------------  1988
                                                                                      
Sbjct 2295  AGGGAACCCTAAAGGACAAAGAACCTCAGGGGCTCAGGTCCTTCCCCAAAGAGGGTGGTCTGGGAGCTGCTGAG  2368

Query 1989  --------------------------------------------------------------------------  1988
                                                                                      
Sbjct 2369  AGACAGGTCAGAGGCTTCCACCGTGGCTGCAGCCAGAAGGGCCTGGAGCTGCCCCTGCTCCCCACTCCTGGCCA  2442

Query 1989  ---------TGAGCAGGTGCTGCACCTGTGGCTGGAGGTGCTCTGCTCCAGCCTGCCCACCGTGGAGAAGTGGT  2053
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TGTCCCCAGTGAGCAGGTGCTGCACCTGTGGCTGGAGGTGCTCTGCTCCAGCCTGCCCACCGTGGAGAAGTGGT  2516

Query 2054  ACCAGCCCTGGTCCTTCCTGCGCAGCCCGGGCTGGGTCCAGATCAAGTGTGAGCTCCGAGTCCTCTGCTGCTTT  2127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACCAGCCCTGGTCCTTCCTGCGCAGCCCGGGCTGGGTCCAGATCAAGTGTGAGCTCCGAGTCCTCTGCTGCTTT  2590

Query 2128  GCCTTCAGCCTCTCCCAGGACTGGGAGCTCCCTGCGAAGAGAGAGGCGCAGCAGCCCCTGAAGGAGGGCGTCCG  2201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCCTTCAGCCTCTCCCAGGACTGGGAGCTCCCTGCGAAGAGAGAGGCGCAGCAGCCCCTGAAGGAGGGCGTCCG  2664

Query 2202  GGACATGCTGGTGAAGCACCACCTCTTCAGCTGGGATGTGGACGGG----------------------------  2247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 2665  GGACATGCTGGTGAAGCACCACCTCTTCAGCTGGGATGTGGACGGGTGACCCCCTCCTCCCCAGCCCAACCTCG  2738

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2739  GGCCTGCGTCTGAGGTGGCCCAGGACCCCAAGCTGCAGAGCCCAGGGAAGAGCAGCTCCAGAGCCCTGGCCGGG  2812

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2813  GCCGCGGGATATCAATATCAGGCTGCCCCACTCCACGTTCCCCAGCACATCCCAGGTGGTGGGAGCAGAGGGTA  2886

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2887  CCCTGCCCCACCAGGGTCCTTAGGGATGCTCTAGGCCAAACCACAGTTTGTACCAAAAACCTTGTGAGGAGGTG  2960

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2961  GGGGAGCCATGTCTGTGCTCAGGAAGAGGGAAGGGGATGGGGGTGGCTAGTAGGCTCCTGGCCTCTTTGGTTTA  3034

Query 2248  -------------------------------  2247
                                           
Sbjct 3035  TAAATAAACTGTGTCTGTCTTTGAGAAAGCA  3065