Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03039
• Subject: XR_002958687.1
• Aligned Length: 2871
• Identities: 2247
• Gaps: 624

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTGGGGAAGCTGCTAACCCGACCCGGATTGGCGCTGAGGTGGCCCGTGGGGCAGGGCAGATGATTCTGGACCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT  148

Query    1  -----------------ATGTCAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATA  57
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATA  222

Query   58  TGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGA  131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGA  296

Query  132  GTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGG  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGG  370

Query  206  AGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACC  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACC  444

Query  280  TGGGACAAGATTGCCGTCTCCCTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGG  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGGACAAGATTGCCGTCTCCCTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGG  518

Query  354  CATGAGGCCACAGCTGTGGATGCGGCTCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCG  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGAGGCCACAGCTGTGGATGCGGCTCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCG  592

Query  428  AGATTGTGAAGAACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATG  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTGTGAAGAACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATG  666

Query  502  CCCAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCTCCGGGCCCTGGC  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCTCCGGGCCCTGGC  740

Query  576  CTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGG  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGG  814

Query  650  AGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTGCCATCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTG  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTGCCATCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTG  888

Query  724  CTGGGTGTCCAGACTGACCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGGTGTCCAGACTGACCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCT  962

Query  798  CCAGGAGCATGACATTGAGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGTGGACA  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGGAGCATGACATTGAGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGTGGACA  1036

Query  872  TCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCTGTTCCAGCTCACGCTGGGC  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCTGTTCCAGCTCACGCTGGGC  1110

Query  946  ATGCTGCACCTCAAGGAGGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTATCGGATAT  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGCTGCACCTCAAGGAGGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTATCGGATAT  1184

Query 1020  CCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGGCCGGCTCCCTCACCGATGTGG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGGCCGGCTCCCTCACCGATGTGG  1258

Query 1094  CCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACCTGGCCTATCTCATTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACC  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACCTGGCCTATCTCATTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACC  1332

Query 1168  CTCACCAACCTCTCTCAGGTTGTTCGCCGCAGGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGG  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCACCAACCTCTCTCAGGTTGTTCGCCGCAGGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGG  1406

Query 1242  GGAGGATGACCTGGAGGCACTCAAGGCCAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGGAAGCCA  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGGATGACCTGGAGGCACTCAAGGCCAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGGAAGCCA  1480

Query 1316  TCCTGCGCGTGGCACGCCACTTCCAGTGCACAGACCCCAAAAACTGCAGCGT----------------------  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1481  TCCTGCGCGTGGCACGCCACTTCCAGTGCACAGACCCCAAAAACTGCAGCGTGGTGAGTCGCCAGCTCCCTGGG  1554

Query 1368  --------------------------------------------------------------GGAGCTGACTCC  1379
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCTACCAAACACGGCCCTAACTCCTCCAACCCCCTTGGTGGGCCTGTGTTCACTGTGGCAGGAGCTGACTCC  1628

Query 1380  AGACTATAGCATGGAGAGCCACCAGCGGGACCACGAGAACTACGTGGCGTGCTCACGCAGCCACCGGCGCCGAG  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGACTATAGCATGGAGAGCCACCAGCGGGACCACGAGAACTACGTGGCGTGCTCACGCAGCCACCGGCGCCGAG  1702

Query 1454  CCAAGGCCCTGCTGGACTTTGAGCGGCACGACGACGACGAGCTGGGCTTCCGCAAGAACGACATCATCACAATC  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCAAGGCCCTGCTGGACTTTGAGCGGCACGACGACGACGAGCTGGGCTTCCGCAAGAACGACATCATCACAATC  1776

Query 1528  GTGTCTCAGAAGGACGAGCACTGCTGGGTGGGGGAGCTCAACGGCCTGCGAGGCTGGTTTCCAGCCAAGTTCGT  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGTCTCAGAAGGACGAGCACTGCTGGGTGGGGGAGCTCAACGGCCTGCGAGGCTGGTTTCCAGCCAAGTTCGT  1850

Query 1602  GGAAGTCCTGGATGAGCGCAGCAAAGAGTACTCCATCGCGGGGGATGACTCGGTGACGGAGGGGGTCACAGACC  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAAGTCCTGGATGAGCGCAGCAAAGAGTACTCCATCGCGGGGGATGACTCGGTGACGGAGGGGGTCACAGACC  1924

Query 1676  TCGTGCGAGGGACCCTCTGCCCGGCCCTTAAGGCCCTGTTCGAACATGGACTGAAGAAGCCATCCCTGCTTGGG  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCGTGCGAGGGACCCTCTGCCCGGCCCTTAAGGCCCTGTTCGAACATGGACTGAAGAAGCCATCCCTGCTTGGG  1998

Query 1750  GGCGCCTGCCACCCCTGGCTGTTTATCGAGGAGGCTGCAGGCCGGGAGGTCGAGAGAGACTTTGCCTCCGTGTA  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGCGCCTGCCACCCCTGGCTGTTTATCGAGGAGGCTGCAGGCCGGGAGGTCGAGAGAGACTTTGCCTCCGTGTA  2072

Query 1824  TTCCCGTCTGGTGCTCTGTAAGACCT--------------------TCAGGTTGGATGAAGATGGCAAAGTCCT  1877
            ||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTCCCGTCTGGTGCTCTGTAAGACCTTCAGGAGCTTTGGTGTCCCCTCAGGTTGGATGAAGATGGCAAAGTCCT  2146

Query 1878  GACCCCGGAGGAGCTGCTCTACCGGGCTGTGCAGTCTGTGAACGTGACCCACGATGCAGTGCATGCACAAATGG  1951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GACCCCGGAGGAGCTGCTCTACCGGGCTGTGCAGTCTGTGAACGTGACCCACGATGCAGTGCATGCACAAATGG  2220

Query 1952  ATGTGAAGCTCCGCTCACTGATCTGCGTGGGGCTCAATGAGCAGGTGCTGCACCTGTGGCTGGAGGTGCTCTGC  2025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATGTGAAGCTCCGCTCACTGATCTGCGTGGGGCTCAATGAGCAGGTGCTGCACCTGTGGCTGGAGGTGCTCTGC  2294

Query 2026  TCCAGCCTGCCCACCGTGGAGAAGTGGTACCAGCCCTGGTCCTTCCTGCGCAGCCCGGGCTGGGTCCAGATCAA  2099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCCAGCCTGCCCACCGTGGAGAAGTGGTACCAGCCCTGGTCCTTCCTGCGCAGCCCGGGCTGGGTCCAGATCAA  2368

Query 2100  GTGTGAGCTCCGAGTCCTCTGCTGCTTTGCCTTCAGCCTCTCCCAGGACTGGGAGCTCCCTGCGAAGAGAGAGG  2173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GTGTGAGCTCCGAGTCCTCTGCTGCTTTGCCTTCAGCCTCTCCCAGGACTGGGAGCTCCCTGCGAAGAGAGAGG  2442

Query 2174  CGCAGCAGCCCCTGAAGGAGGGCGTCCGGGACATGCTGGTGAAGCACCACCTCTTCAGCTGGGATGTGGACGGG  2247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CGCAGCAGCCCCTGAAGGAGGGCGTCCGGGACATGCTGGTGAAGCACCACCTCTTCAGCTGGGATGTGGACGGG  2516

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2517  TGACCCCCTCCTCCCCAGCCCAACCTCGGGCCTGCGTCTGAGGTGGCCCAGGACCCCAAGCTGCAGAGCCCAGG  2590

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2591  GAAGAGCAGCTCCAGAGCCCTGGCCGGGGCCGCGGGATATCAATATCAGGCTGCCCCACTCCACGTTCCCCAGC  2664

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2665  ACATCCCAGGTGGTGGGAGCAGAGGGTACCCTGCCCCACCAGGGTCCTTAGGGATGCTCTAGGCCAAACCACAG  2738

Query 2248  --------------------------------------------------------------------------  2247
                                                                                      
Sbjct 2739  TTTGTACCAAAAACCTTGTGAGGAGGTGGGGGAGCCATGTCTGTGCTCAGGAAGAGGGAAGGGGATGGGGGTGG  2812

Query 2248  -----------------------------------------------------------  2247
                                                                       
Sbjct 2813  CTAGTAGGCTCCTGGCCTCTTTGGTTTATAAATAAACTGTGTCTGTCTTTGAGAAAGCA  2871