Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03094
• Subject: XM_006721185.2
• Aligned Length: 1465
• Identities: 1377
• Gaps: 65

Alignment

Query    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74

Query   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148

Query  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222

Query  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296

Query  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370

Query  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444

Query  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518

Query  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592

Query  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666

Query  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740

Query  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814

Query  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888

Query  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962

Query  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTCGCCCTGCCTCCCCGGATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |.||||||.|..||
Sbjct  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAA------------TCCCTCCCAGTTTC  1024

Query 1037  ---CGACCCCAGG-TAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGAAAGAAGCCTCTACC  1106
               |.||||..|| .|.|.||.|          |||||                       |..|.|||||.||
Sbjct 1025  TTGCCACCCGTGGCCAAGCGGAA----------CCTCC-----------------------ACCACCCTCTTCC  1065

Query 1107  CTGG---CGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGC---GATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCTCTGCAGAAAAA  1174
            |..|   |.|||||| ||||.||      |   |||   ..|.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  CCAGACACTCTCGCC-CTGCCTC------CCCGGAT---CCGACCCCAGGCTCCCCCGTGTCTCTGCAGAAAAA  1129

Query 1175  GAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCGGCGTCGGGGCCTAGGGCCCCCAGCC  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  GAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCGGCGTCGGGGCCTAGGGCCCCCAGCC  1203

Query 1249  GCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGACGCCAGCCCTGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCAC  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  GCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGACGCCAGCCCTGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCAC  1277

Query 1323  TCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCC  1396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  TCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCC  1351

Query 1397  GCGGGGCCGGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCGTGCGCCCGCCGTTTTCG  1455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  GCGGGGCCGGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCGTGCGCCCGCCGTTTTCG  1410