Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03094
- Subject:
- XM_011248501.2
- Aligned Length:
- 1553
- Identities:
- 1181
- Gaps:
- 199
Alignment
Query 1 ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC 74
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..|
Sbjct 1 ---------ATGAACATCTGCAACAAACCCTCCAACAAGACAGCCCCCGAGAAGAGTGTGTGGACAGCGCCCTC 65
Query 75 ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC 148
||||..|||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 66 ACAGGACAGTGGGCCTTCCCCAGAACTGCAGGGCCAGCGCTCTCGAAGGAATGGATGGAGCTGGCCGCCCCACC 139
Query 149 CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG 222
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 140 CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTCTACCTCTTCTTCGCGGTGATTGGCTTTGGGGTCCTTGTTCCCCTCTTG 213
Query 223 CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC 296
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 CCTCACCACTGGGTGCCTGCTGGCTATGCTTGCATGGGGGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC 287
Query 297 CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC 370
.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 TGCTGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAATGTGCGGGACAAGAGCTACTCTGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC 361
Query 371 GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG 444
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.|||||.||.||.|||||.
Sbjct 362 GCAGCCAGCATGCGCATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACCTATGCGACGTGGACGTGAGTGCGCGATCCAAA 435
Query 445 CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA 518
|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 436 CACTGCAGCGCCTGCAATAAGTGCGTATGCGGCTTCGATCACCATTGCAAGTGGCTCAACAACTGCGTGGGCGA 509
Query 519 GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA 592
|.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 GAGGAACTATCGGCTCTTTCTACACAGTGTGGCATCTGCTTTATTGGGTGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA 583
Query 593 CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT 666
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|||||||||||||.|||||||.
Sbjct 584 CTTATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGACTTCGTACCAACCAACACTTTGAAGTCTTGAAGAAC 657
Query 667 CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC 740
|||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CACACGGATGTGTGGTTTGTGTTCTTGCCTGCTGCCCCTGTGGAGACCCAGGCTCCTGCCATCCTGGCCCTGGC 731
Query 741 CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA 814
||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 732 CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTGCTTTCTACAGCCCTGCTTGGCCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTAA 805
Query 815 TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG 888
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.||.||||.|...||||.|
Sbjct 806 TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAATACATCGTGCAGCACCGTCCAGCTCAGGAAGCAAAGGAGACCCACAAG 879
Query 889 GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT 962
|||||.||||||||.||.|.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|
Sbjct 880 GAGCTGGAGTCATGCCCCCGCAAGGTGCGGTCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGAGGACCTTCAGCCATGT 953
Query 963 GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTCGCCCTGCCTCCCCGGATC 1036
|||.|||||||||.||||||||||..||.||||||||.|.|||||||| |.|.||||.|..||
Sbjct 954 GCGTCCAGAGCCCTCTGGCCAGGCTAGGACAGCAGCATTAAATGCCAA------------TCCTTCCCAGTTTC 1015
Query 1037 ---CGACCCCAGGTAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGAAAGAAGCCTCTACCC 1107
|.||||.||| |||.||||| |..| ||.||||||
Sbjct 1016 TTGCCACCCAAGG---------------------------CCAAGTGGA-------ACCA-----CCACTACCC 1050
Query 1108 TGGCGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCTCTG--------------- 1166
| ||| ||||||.|.|.| ||.|||||
Sbjct 1051 T--------CCT------------------------CCTCAGACACAC---TGGCTCTGCCTCCACGGATCCAA 1089
Query 1167 ---CAGAAAAAGAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCG---GC--------- 1225
|||||||||||||||.||||.|||||||.|.|||..|.|||||.|..||.||| ||| ||
Sbjct 1090 CCCCAGAAAAAGAGGAAGCGGCGAGTGTATAGATTGCCCAGGTCTGGGGTCTTGGA-CCGAGAGCTCCCACTGC 1162
Query 1226 ----GT--CGGG-GCCTAGGGCCCCCAGCCGCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGAC----GCCAGCCC 1288
|| |||| |.||.||.|.||.|||||||||||||||||.||..|.|||||| || ||||||||
Sbjct 1163 CCAGGTTACGGGAGACTGGGACTCCTAGCCGCCGCTCCAGCTCTTCATCTGATTCC----ACCAGTGCCAGCCC 1232
Query 1289 TGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACTCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGC 1362
.|||||.||.|.||||.||||.|||||||||.|||||||.||.||.||||||.||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1233 AGTGCATGCTGGTGGCTCTGCAGGCGCCTACTACTCGGCATCAGCTGAGTCCATGGAAGAGATTCCAGTGGCCC 1306
Query 1363 AGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCGCGGGGCC-GGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGC 1435
||||||||||||||||.|||||.||||..||||| .||.||| ||||.|||.||.|...||||||.|..|||||
Sbjct 1307 AGACGCGCCTGGGCAGTGCCGCACTGGGTGCCCC-AGGAGCCAGGGGTCGAGAGTCTGGGCTGGCTCTACAGGC 1379
Query 1436 GCGTGCGCCCGCCGTTTTCG----------------------------------------------------- 1455
.|||.||||.||.|||||.|
Sbjct 1380 ACGTTCGCCTGCTGTTTTTGTGAGCCCGAGCAGTGGCGAGCCCGGAACACCTGGAGGCGGCGACGGCCTGCCT 1452