Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03094
• Subject: XM_017312961.1
• Aligned Length: 1571
• Identities: 1176
• Gaps: 223

Alignment

Query    1  ATG-----TAC-------------AAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAG  56
            |||     |||             .|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCTCTCTACTCTTCTCCCTCTGGAGATGAACATCTGCAACAAACCCTCCAACAAGACAGCCCCCGAGAAGAG  74

Query   57  TGTGTGGACGGCACCGGCACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGT  130
            |||||||||.||.||..|||||..|||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|
Sbjct   75  TGTGTGGACAGCGCCCTCACAGGACAGTGGGCCTTCCCCAGAACTGCAGGGCCAGCGCTCTCGAAGGAATGGAT  148

Query  131  GGAGCTGGCCCCCTCACCCGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGG  204
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  149  GGAGCTGGCCGCCCCACCCGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTCTACCTCTTCTTCGCGGTGATTGGCTTTGGG  222

Query  205  ATCCTTGTTCCCCTCCTGCCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCA  278
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCTTGTTCCCCTCTTGCCTCACCACTGGGTGCCTGCTGGCTATGCTTGCATGGGGGCCATCTTTGCTGGCCA  296

Query  279  CCTTGTGGTGCACCTGACCGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGC  352
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||
Sbjct  297  CCTTGTGGTGCACCTGACTGCTGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAATGTGCGGGACAAGAGCTACTCTGGGC  370

Query  353  CCCTGCCCATCTTCAACCGAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGAT  426
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.
Sbjct  371  CCCTGCCCATCTTCAACCGCAGCCAGCATGCGCATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACCTATGCGACGTGGAC  444

Query  427  GTGAGCGCTCGCTCCAAGCACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCT  500
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  GTGAGTGCGCGATCCAAACACTGCAGCGCCTGCAATAAGTGCGTATGCGGCTTCGATCACCATTGCAAGTGGCT  518

Query  501  CAACAACTGTGTGGGCGAGCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGC  574
            |||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||
Sbjct  519  CAACAACTGCGTGGGCGAGAGGAACTATCGGCTCTTTCTACACAGTGTGGCATCTGCTTTATTGGGTGTCCTGC  592

Query  575  TCCTGGTGCTGGTGGCCACATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACAC  648
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||
Sbjct  593  TCCTGGTGCTGGTGGCCACTTATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGACTTCGTACCAACCAACAC  666

Query  649  TTTGAAGTCCTGAAGAATCACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCC  722
            |||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTTGAAGTCTTGAAGAACCACACGGATGTGTGGTTTGTGTTCTTGCCTGCTGCCCCTGTGGAGACCCAGGCTCC  740

Query  723  TGCCATCCTGGCCCTGGCCGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  TGCCATCCTGGCCCTGGCCGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTGCTTTCTACAGCCCTGCTTGGCCACCTGCTCT  814

Query  797  GCTTCCACATTTATCTCATGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAG  870
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.
Sbjct  815  GCTTCCACATTTATCTAATGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAATACATCGTGCAGCACCGTCCAGCTCAGGAA  888

Query  871  GCCAAGGGGGTTCACAGGGAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACAT  944
            ||.||||.|...||||.||||||.||||||||.||.|.||               |||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAAAGGAGACCCACAAGGAGCTGGAGTCATGCCCCCGCA---------------AGGAGATGGAGTTCTACAT  947

Query  945  GCGGACCTTCAGACATATGCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTC  1018
            |.||||||||||.|||.||||.|||||||||.||||||||||..||.||||||||.|.||||||||        
Sbjct  948  GAGGACCTTCAGCCATGTGCGTCCAGAGCCCTCTGGCCAGGCTAGGACAGCAGCATTAAATGCCAA--------  1013

Query 1019  GCCCTGCCTCCCCGGATC---CGACCCCAGGTAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGAT  1089
                |.|.||||.|..||   |.||||.|||                           |||.|||||       
Sbjct 1014  ----TCCTTCCCAGTTTCTTGCCACCCAAGG---------------------------CCAAGTGGA-------  1049

Query 1090  AGAAAGAAGCCTCTACCCTGGCGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCT  1163
            |..|     ||.|||||||        |||                        ||||||.|.|.|   ||.||
Sbjct 1050  ACCA-----CCACTACCCT--------CCT------------------------CCTCAGACACAC---TGGCT  1083

Query 1164  CTG------------------CAGAAAAAGAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGA  1219
            |||                  |||||||||||||||.||||.|||||||.|.|||..|.|||||.|..||.|||
Sbjct 1084  CTGCCTCCACGGATCCAACCCCAGAAAAAGAGGAAGCGGCGAGTGTATAGATTGCCCAGGTCTGGGGTCTTGGA  1157

Query 1220  TCCG---GC-------------GT--CGGG-GCCTAGGGCCCCCAGCCGCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCC  1274
             |||   ||             ||  |||| |.||.||.|.||.|||||||||||||||||.||..|.||||||
Sbjct 1158  -CCGAGAGCTCCCACTGCCCAGGTTACGGGAGACTGGGACTCCTAGCCGCCGCTCCAGCTCTTCATCTGATTCC  1230

Query 1275  GCGGAC----GCCAGCCCTGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACTCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGG  1344
                ||    ||||||||.|||||.||.|.||||.||||.|||||||||.|||||||.||.||.||||||.|||
Sbjct 1231  ----ACCAGTGCCAGCCCAGTGCATGCTGGTGGCTCTGCAGGCGCCTACTACTCGGCATCAGCTGAGTCCATGG  1300

Query 1345  ACGAGATTCCAGTGGCGCAGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCGCGGGGCC-GGGGCCGACAGCC  1417
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||..||||| .||.||| ||||.|||.||.|
Sbjct 1301  AAGAGATTCCAGTGGCCCAGACGCGCCTGGGCAGTGCCGCACTGGGTGCCCC-AGGAGCCAGGGGTCGAGAGTC  1373

Query 1418  CACGCTGGCGCGGCAGGCGCGTGCGCCCGCCGTTTTCG------------------------------------  1455
            ...||||||.|..|||||.|||.||||.||.|||||.|                                    
Sbjct 1374  TGGGCTGGCTCTACAGGCACGTTCGCCTGCTGTTTTTGTGAGCCCGAGCAGTGGCGAGCCCGGAACACCTGGAG  1447

Query 1456  -----------------  1455
                             
Sbjct 1448  GCGGCGACGGCCTGCCT  1464