Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03094
• Subject: XM_024450248.1
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1068
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74

Query   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148

Query  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222

Query  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296

Query  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370

Query  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444

Query  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518

Query  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592

Query  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666

Query  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740

Query  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814

Query  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888

Query  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962

Query  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTCGCCCTGCCTCCCCGGATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTCGCCCTGCCTCCCCGGATC  1036

Query 1037  CGACCCCAGGTAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGAAAGAAGCCTCTACCCTGG  1110
            ||||||                                                                    
Sbjct 1037  CGACCC--------------------------------------------------------------------  1042

Query 1111  CGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCTCTGCAGAAAAAGAGGAAGAGG  1184
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 1043  --------------------------------------------------------CAGAAAAAGAGGAAGAGG  1060

Query 1185  CGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCGGCGTCGGGGCCTAGGGCCCCCAGCCGCCGCTCCAG  1258
            ||||||||                                                                  
Sbjct 1061  CGCGTGTA------------------------------------------------------------------  1068

Query 1259  CTCGTCGACGGATTCCGCGGACGCCAGCCCTGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACTCGGCGTCGG  1332
                                                                                      
Sbjct 1069  --------------------------------------------------------------------------  1068

Query 1333  CAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCGCGGGGCCGG  1406
                                                                                      
Sbjct 1069  --------------------------------------------------------------------------  1068

Query 1407  GGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCGTGCGCCCGCCGTTTTCG  1455
                                                             
Sbjct 1069  -------------------------------------------------  1068