Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03116
- Subject:
- NM_013381.2
- Aligned Length:
- 3072
- Identities:
- 3072
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGGGGAAGACGACGCCGCGCTTCGGGCTGGCAGCAGGGGGCTCTCCGACCCGTGGGCAGACTCAGTGGGAGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGGAAGACGACGCCGCGCTTCGGGCTGGCAGCAGGGGGCTCTCCGACCCGTGGGCAGACTCAGTGGGAGT 74
Query 75 GCGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCCGTACACAAGCGGCTTGTGCTGGCCTTCGCTGTGTCCCTCGTGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCCGTACACAAGCGGCTTGTGCTGGCCTTCGCTGTGTCCCTCGTGG 148
Query 149 CATTGCTCGCGGTCACAATGCTCGCTGTGCTGCTCAGCCTGCGCTTCGACGAGTGCGGGGCGAGTGCCACGCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CATTGCTCGCGGTCACAATGCTCGCTGTGCTGCTCAGCCTGCGCTTCGACGAGTGCGGGGCGAGTGCCACGCCA 222
Query 223 GGCGCCGACGGTGGCCCCTCAGGCTTTCCGGAGCGCGGCGGCAACGGGAGCCTCCCTGGATCGGCCCGGCGCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCGCCGACGGTGGCCCCTCAGGCTTTCCGGAGCGCGGCGGCAACGGGAGCCTCCCTGGATCGGCCCGGCGCAA 296
Query 297 CCACCACGCAGGCGGGGACTCCTGGCAGCCCGAGGCGGGTGGGGTGGCCAGTCCGGGGACCACGTCGGCCCAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCACCACGCAGGCGGGGACTCCTGGCAGCCCGAGGCGGGTGGGGTGGCCAGTCCGGGGACCACGTCGGCCCAGC 370
Query 371 CGCCGTCGGAGGAGGAGCGGGAGCCGTGGGAGCCGTGGACGCAGCTGCGCCTGTCGGGCCACCTGAAGCCGCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGCCGTCGGAGGAGGAGCGGGAGCCGTGGGAGCCGTGGACGCAGCTGCGCCTGTCGGGCCACCTGAAGCCGCTG 444
Query 445 CACTACAATCTGATGCTCACCGCCTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCCGGGGAGGTCAACGTGGAGATCGCGTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTACAATCTGATGCTCACCGCCTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCCGGGGAGGTCAACGTGGAGATCGCGTG 518
Query 519 CCGGAACGCCACCCGCTACGTAGTGCTGCACGCTTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAAGTGCAGCTGGCCGAGGACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGGAACGCCACCCGCTACGTAGTGCTGCACGCTTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAAGTGCAGCTGGCCGAGGACC 592
Query 593 GGGCGTTCGGGGCTGTCCCTGTAGCCGGTTTTTTCCTCTACCCGCAAACCCAGGTCTTAGTGGTGGTGCTGAAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGCGTTCGGGGCTGTCCCTGTAGCCGGTTTTTTCCTCTACCCGCAAACCCAGGTCTTAGTGGTGGTGCTGAAT 666
Query 667 AGGACACTGGACGCGCAGAGGAATTACAATCTGAAGATTATCTACAACGCGCTCATCGAGAATGAGCTCCTGGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGGACACTGGACGCGCAGAGGAATTACAATCTGAAGATTATCTACAACGCGCTCATCGAGAATGAGCTCCTGGG 740
Query 741 CTTCTTCCGCAGCTCCTATGTGCTCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCGCCTACACATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTCTTCCGCAGCTCCTATGTGCTCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCGCCTACACATG 814
Query 815 CCAGAAAGGCATTTCCTTGTTTTGATGAGCCAATCTACAAGGCTACTTTCAAAATCAGCATCAAGCATCAAGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGAAAGGCATTTCCTTGTTTTGATGAGCCAATCTACAAGGCTACTTTCAAAATCAGCATCAAGCATCAAGCA 888
Query 889 ACCTATTTATCTTTATCTAATATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATCACTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACCTATTTATCTTTATCTAATATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATCACTT 962
Query 963 TTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACTACCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACTACCA 1036
Query 1037 CCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGCTCTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGCTCTC 1110
Query 1111 CATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAGATCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAGATCT 1184
Query 1185 TTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGAATAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGAATAC 1258
Query 1259 TGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATGTCAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATGTCAC 1332
Query 1333 CAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACTACTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACTACTT 1406
Query 1407 TGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTTCTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTTCTGC 1480
Query 1481 ATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGATATT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGATATT 1554
Query 1555 GACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGGGCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGGGCCA 1628
Query 1629 TTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGATCTCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGATCTCT 1702
Query 1703 GGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTGGACA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTGGACA 1776
Query 1777 CTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCCAACA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCCAACA 1850
Query 1851 GCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAGATTC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAGATTC 1924
Query 1925 CATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATCAGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATCAGAG 1998
Query 1999 CACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTAGAGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTAGAGT 2072
Query 2073 CAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTCAGTA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTCAGTA 2146
Query 2147 ACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCTGGAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCTGGAG 2220
Query 2221 ATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTCTAGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTCTAGA 2294
Query 2295 TAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACATATA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACATATA 2368
Query 2369 TCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACTACGT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACTACGT 2442
Query 2443 AGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTTCAGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTTCAGA 2516
Query 2517 TTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCACTAC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCACTAC 2590
Query 2591 TGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAATATTA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAATATTA 2664
Query 2665 TTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTGAGGT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTGAGGT 2738
Query 2739 GGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCCTGGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCCTGGA 2812
Query 2813 AGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACTCATC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACTCATC 2886
Query 2887 AGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATGATGG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATGATGG 2960
Query 2961 GGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTACCAAG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTACCAAG 3034
Query 3035 ACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC 3072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC 3072