Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03136
• Subject: XM_006527470.3
• Aligned Length: 858
• Identities: 697
• Gaps: 102

Alignment

Query   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74
           |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct   1  ATGCGGGGCCAAGGCCGAAAGGAGAGTTTGTCCGAATCCCGAGATTTGGACGGCTCCTATGACCAGCTTACGGG  74

Query  75  CCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAGCGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148
           |||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCACCCTCCAGGGCCCAGTAAAAAAGCCCTGAAGCAGCGTTTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148

Query 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAA-----------------------------------------------------  169
           |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAATTGGCCTGCTCTTCTGCCGCCTTCTCGGTGACAATTCGCTCCCTTCAGCATTA  222

Query 170  -------------------------------------------------ACAGCGTGGACGATGAATTTGAATT  194
                                                            ||||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct 223  GCTGCCCCAGCCTCCCTCCGCCCCCACAGACCCCGCCCGCTGGACCCAGACAGCGTGGAGGATGAGTTTGAACT  296

Query 195  GTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGC  268
           .|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||..|||||||
Sbjct 297  ATCCACGGTGTGCCACCGGCCTGAGGGTCTGGAACAACTCCAGGAACAAACCAAGTTCACACGCAGAGAGTTGC  370

Query 269  AGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTAC  342
           |||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 371  AGGTCCTGTACAGAGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAACGAGGAGAACTTCAAGCAAATTTAT  444

Query 343  TCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGA  416
           ||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TCTCAGTTCTTTCCCCAAGGAGACTCCAGCAACTACGCTACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGA  518

Query 417  TGGCTCGGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTA  490
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||.||.|
Sbjct 519  TGGCTCTGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCAGTGATTCTTCGGGGAACCATAGATGATAGACTGA  592

Query 491  ATTGGGCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAG  564
           |.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593  ACTGGGCTTTCAACTTATATGACCTCAACAAGGATGGCTGTATCACGAAGGAGGAAATGCTCGACATCATGAAG  666

Query 565  TCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAG  638
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667  TCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACCTACCCTGCCCTCCGGGAGGAGGCCCCGAGGGAACACGTGGAGAG  740

Query 639  CTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGG  712
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 741  CTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGACGGCGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAACAGG  814

Query 713  ATGAGAACATCATGAGGTCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC  756
           |.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 815  ACGAGAACATCATGAGGTCCATGCAACTCTTTGATAATGTCATC  858