Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03136
• Subject: XM_006717812.2
• Aligned Length: 836
• Identities: 739
• Gaps: 91

Alignment

Query   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74

Query  75  CCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAGCGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAGCGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148

Query 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAA-----------------------------------------------------  169
           |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAACATTAGCCGCCCCAGCCTCCCTCCGCCCCCACAGACCCCGCCTGCTGGACCCA  222

Query 170  -ACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCA  242
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCA  296

Query 243  AACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCA  316
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCA  370

Query 317  ATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTC  390
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTC  444

Query 391  TTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCT  464
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCT  518

Query 465  TCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCA  538
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCA  592

Query 539  AGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAG  612
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAG  666

Query 613  GAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGA  686
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGA  740

Query 687  GGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGG---ATGAGAACATCAT---------------------GAGG--TCCAT  734
           ||||||||||||||||||||||||||   ||     |.||||                     ||||  ||||.
Sbjct 741  GGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGGTCTAT-----CCTCATCCTACGCCTCCCTGGGGGCTGGAGGGATCCAA  809

Query 735  GCAGCTCTTTGACAATGTCATC  756
           | |||   |||...|| |||. 
Sbjct 810  G-AGC---TTGGGGAT-TCAG-  825