Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03136
• Subject: XM_011539731.2
• Aligned Length: 791
• Identities: 635
• Gaps: 136

Alignment

Query   1  --------ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAG  66
                   ||||    ||    |||||              |.|.||.|||.||      |||           
Sbjct   1  ATGAACCGATGC----CC----CCGCA--------------GGTGCCGGAGCCC------GCT-----------  35

Query  67  CTCACGGGCCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAGCGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTG-CTGCG  139
                |||.||        |||          |||         |||||.||||.|.|.||||  ||| |||.|
Sbjct  36  -----GGGGCA--------GGC----------AGC---------GCGATCCCTCTACCAGCTG--GTGACTGGG  75

Query 140  GGCCCCAAGCCCTGCCCTCAGTCAGTGAAAACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGG  213
                   .|.|||.||.|||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  76  --------TCGCTGTCCCCAG---------ACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGG  132

Query 214  CCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTT  287
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133  CCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTT  206

Query 288  CAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAG  361
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207  CAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAG  280

Query 362  GAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAG  435
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281  GAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAG  354

Query 436  GACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTA  509
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355  GACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTA  428

Query 510  TGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGG  583
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429  TGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGG  502

Query 584  GCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGAC  657
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503  GCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGAC  576

Query 658  AGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGG---ATGAGAACATCAT---  725
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     |.||||   
Sbjct 577  AGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGGTCTAT-----CCTCATCCT  645

Query 726  ------------------GAGG--TCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC  756
                             ||||  ||||.| |||   |||...|| |||. 
Sbjct 646  ACGCCTCCCTGGGGGCTGGAGGGATCCAAG-AGC---TTGGGGAT-TCAG-  690