Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03181
Subject:
NM_026210.4
Aligned Length:
619
Identities:
525
Gaps:
8

Alignment

Query   1  ATGTTGCAGCAGGATAGTAATGATGACACTGAAGATGTTTCACTGTTTGATGCGGAAGAGGAGACGACTAATAG  74
           ||||||..||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct   1  ATGTTGTCGCAGGACAGTAATGATGACACTGAAGATGTCTCACTGTTTGATGCAGAAGAGGAGACAACCAATAG  74

Query  75  ACCAAGAAAAGCCAAAATCAGACATCCAGTAGCATCGTTTTTCCACTTATTCTTTCGAGTCAGTGCAATCATCG  148
           ||||||||||.||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||..|.|||||.||.||||||||..|..|.|
Sbjct  75  ACCAAGAAAATCCAAAATCAGGCACCCCGTGGCATCCTTCTTCCATCTGTTCTTCCGGGTCAGTGCGGTTGTGG  148

Query 149  TCTATCTTCTCTGTGGGTTGCTCAGCAGCAGCTTTATTACCTGTATGGTGACAATTATCTTGTTGTTGTCGTGT  222
           |||||||.||.||.|.|.|||||||.|||||||||||..||||.||||||||||||||||||.||.||||.||.
Sbjct 149  TCTATCTCCTTTGCGAGCTGCTCAGTAGCAGCTTTATCGCCTGCATGGTGACAATTATCTTGCTGCTGTCATGC  222

Query 223  GACTTTTGGGCAGTGAAGAATGTCACAGGTAGACTAATGGTTGGCCTACGTTGGTGGAATCACATTGATGAAGA  296
           ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223  GACTTTTGGGCAGTAAAGAATGTCACAGGTAGACTAATGGTCGGCCTGCGTTGGTGGAATCATATTGATGAGGA  296

Query 297  TGGAAAGAGCCATTGGGTGTTTGAATCTAGAAAGGAGTC----CTCTCAAGAGAATAAAACTGTGTCAGAGGCT  366
           |||.||||||||.|||||||||||.||.||||   ||||    | |||||||.||.|||||..|.||.|||||.
Sbjct 297  TGGGAAGAGCCACTGGGTGTTTGAGTCCAGAA---AGTCAACGC-CTCAAGACAACAAAACAATTTCTGAGGCC  366

Query 367  GAATCAAGAATCTTTTGGTTGGGACTTATTGCCTGTCCAGTACTGTGGGTGATATTTGCTTTTAGTGCACTCTT  440
           ||.|||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 367  GAGTCAAGAATCTTTTGGCTAGGACTCATCGCCTGCCCCGTCCTGTGGGTGATCTTTGCCTTTAGTGCCCTCTT  440

Query 441  CTCCTTCAGAGTAAAGTGGTTGGCGGTGGTTATCATGGGTGTGGTGCTACAAGGTGCCAACCTGTATGGTTACA  514
           .||||||.||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 441  TTCCTTCCGAGTGAAGTGGCTGGCTGTGGTGATCATGGGTGTGGTGCTGCAAGGTGCCAACCTATATGGTTATA  514

Query 515  TCAGGTGTAAGGTGCGCAGCAGAAAGCATTTAACCAGCATGGCTACTTCATATTTTGGAAAGCAGTTTTTAAGA  588
           ||.|||||||.|||.||||||..|||.|.|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 515  TCCGGTGTAAAGTGGGCAGCAAGAAGAACTTAACCAGCATGGCTACGTCGTATCTTGGAAAGCAGTTTCTAAGA  588

Query 589  CAAAACACTGGAGATGATCAGACTTCC  615
           ||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 589  CAAAACACTGGAGATGGTCAGACTTCG  615