Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03199
- Subject:
- NM_177066.5
- Aligned Length:
- 2512
- Identities:
- 2136
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGGGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAAACTTGTACTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGT 74
|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||.
Sbjct 1 ATGGGGAATTACAAATCCAGACCGACACAGACTTGTTCTGATGAATGGAAGAAGAAAGTTAGTGAATCTTATGC 74
Query 75 TATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGACCTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTG 148
|||.|.|||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|...|||||||||..|.||.||||
Sbjct 75 TATTATAATAGAAAGGCTGGAAGATGACCTGCAGATCAAAGAAAATGAATTTCAAGAACTAAGACACATCTTTG 148
Query 149 GCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAATTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGT 222
|||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||...|||.|||||.|||||.||..|.||.
Sbjct 149 GCTCTGACGAAGCCTTCAGTGAAGTCAGTTTAAATTACCGCACAGAGCGTGGCCTGTCCCTACTGCACCTCTGC 222
Query 223 TGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATATTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAG 296
||....||.||.|||||.||.||.|||||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 223 TGTGCCTGCGGTGGCAACAAGTCGCATATCCGTGCCCTTATGTTAAAAGGGCTCCGTCCATCCAGACTGACAAG 296
Query 297 AAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCAGTTTACAAGGATAATGC--AGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAG 368
||||||.|||.||||..||||.||.||.||||||||||||| || .|||.|.||||||||.|||.|.||.||
Sbjct 297 AAATGGGTTTCCAGCTCTGCACTTGGCTGTTTACAAGGATA--GCCTGGAACTTATCACTTCACTGTTGCATAG 368
Query 369 TGGAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGGTGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAG 442
.|||||.|||.|.|||||.|..|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||.||||||||||.||||.||
Sbjct 369 CGGAGCAGATGTTCAGCAAGCGGGATATGGCGGCCTCACAGCCCTCCACATCGCTGCAATAGCTGGGCACCCAG 442
Query 443 AGGCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAGCTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCAT 516
||||.|..||.||||||.||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||.||||.
Sbjct 443 AGGCCGTGGAAGTGCTGCTGCAGCATGGAGCCAATGTGAACGTTCAAGATGCAGTCTTCTTCACCCCACTGCAC 516
Query 517 ATTGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTAACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGG 590
||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||..|..|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 517 ATCGCAGCCTATTACGGGCACGAGCAGGTAACCAGTGTCCTTTTGAAGTTTGGAGCTGATGTCAATGTAAGCGG 590
Query 591 TGAAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGCATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAG 664
||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||..|||||| .|||.||
Sbjct 591 TGAAGTTGGAGACAGGCCTCTGCACCTGGCCTCTGCAAAAGGGTTCTTCAACATTGTGAAACTC---CTGGTAG 661
Query 665 AAGGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAGATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGA 738
||||.|.||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 662 AAGGGAACAAAGCCGACGTGAACGCTCAGGACAATGAAGACCATGTCCCTCTGCACTTCTGTTCTCGATTTGGA 735
Query 739 CACCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAAAGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGA 812
|||||..|||||||.|..||..||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||..||||.||||||||.||
Sbjct 736 CACCACAATATAGTGAGCTACTTGCTCCAGAGTGACTTGGAGGTTCAGCCTCACGTCATTAACATCTATGGTGA 809
Query 813 TACCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGGCAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAG 886
.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||..||.|||||||.|
Sbjct 810 CACTCCTTTGCACCTGGCGTGCTACAATGGAAATTTTGAAGTTGCCAAGGAAATTGTCCACGTAACAGGAACTG 883
Query 887 AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGAC 960
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 884 AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAGACAGCTTTTCACAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAACATTGAC 957
Query 961 CTAGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTCATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACA 1034
||.||||||||.||||||||||||||||...|.|||||.|||||.|.||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 958 CTGGTCAAATTCCTTCTTGATCAGAATGCTGTGAACATTAACCATCGAGGAAGAGATGGGCACACAGGATTACA 1031
Query 1035 CTCTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCTGGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGG 1108
|||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1032 CTCTGCTTGCTACCATGGCCACATACGCCTGGTTCAGTTCCTACTGGATAATGGTGCAGATATGAATCTAGTTG 1105
Query 1109 CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCAT 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1106 CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAGAAAGGACAT 1179
Query 1183 GATGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTATAAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCC 1256
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1180 GATGCCATTGTTACACTCCTGAAGCACTATAAGAGACCCCAGGATGAGCTGCCATGTAACGAATATTCTCAGCC 1253
Query 1257 TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCCATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG 1330
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTCCCATCCCCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG 1327
Query 1331 ATATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTTCACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATT 1404
||.||||||||||.||.||||.|||.||.||.|.|||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1328 ATGTTCTCCTCCTGAGGGCTGAATTACCCTCCCGTTTCCATCTGCAGCTCTCGGAAATTGAATTCCATGAGATT 1401
Query 1405 ATTGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATATAAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCG 1478
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1402 ATCGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTCTATAAAGGGCGATGCAGAAATAAAATAGTGGCAATCAAACGATACCG 1475
Query 1479 AGCCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGTGGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATC 1552
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1476 AGCCAACACCTACTGCTCCAAGTCAGACGTGGATATGTTTTGCCGAGAAGTGTCCATCCTCTGCCAGCTCAATC 1549
Query 1553 ATCCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTTGCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATA 1626
|.||||||||..||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1550 ACCCCTGCGTGGTTCAGTTTGTGGGTGCCTGCCTGGATGACCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACACAATACATT 1623
Query 1627 TCAGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCATGAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGC 1700
|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1624 TCAGGAGGCTCTCTGTTCTCCCTGCTTCATGAACAGAAGAGAATTCTTGACTTGCAGTCTAAATTAATCATTGC 1697
Query 1701 AGTAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCTTCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTC 1774
||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||.||||||||.|||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 1698 AGTAGACGTTGCCAAGGGCATGGAGTACCTGCACAGCTTGACCCAGCCAATCATACACCGCGACCTGAACAGTC 1771
Query 1775 ACAATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTG 1848
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1772 ACAATATTCTTCTCTATGAGGACGGCCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTGCAGTCCCTG 1845
Query 1849 GATGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGGAACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCG 1922
||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1846 GATGAAGACAACATGACAAAGCAGCCAGGGAACCTGCGCTGGATGGCCCCCGAGGTGTTCACACAGTGCACGCG 1919
Query 1923 GTACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTATGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCG 1996
.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1920 CTACACCATCAAGGCTGATGTCTTCAGTTACGCCCTGTGTCTGTGGGAGCTCCTCACTGGAGAAATTCCATTCG 1993
Query 1997 CTCATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAGACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATT 2070
|||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1994 CTCATCTGAAGCCAGCCGCTGCAGCAGCAGATATGGCGTACCACCACATCAGACCTCCCATCGGCTACTCCATC 2067
Query 2071 CCCAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGAGGGTGGAACGCATGTCCTGAAGGAAGACCCGAATTTTCTGAAGT 2144
||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 2068 CCCAAGCCAATCTCATCTCTGCTGATGCGGGGCTGGAATGCATGTCCCGAAGGAAGACCCGAGTTCTCTGAAGT 2141
Query 2145 TGTCATGAAGTTAGAAGAGTGTCTCTGCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGGTCTC 2218
.||.|.||||.|.||.|||||.||.||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2142 CGTTAGGAAGCTGGAGGAGTGCCTGTGTAACGTGGAGCTCATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGCTCTC 2215
Query 2219 TCTCACCTTCTTCTTCTTCTGATTGCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGGAGTCATGTGGCAGCATTAAGA 2292
|.||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.
Sbjct 2216 TGTCACCTTCCTCTTCTTCTGATTGCCTACTGAGCCGAGGAGGGCCTGGCCGGAGCCATGTGGCAGCTTTACGG 2289
Query 2293 AGTCGTTTCGAATTGGAATATGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTCCCAAAGTGCTGG-----ACAA 2361
||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||..|||..|.|.|.|||||||..|| |||.
Sbjct 2290 AGTCGTTTTGAGTTGGAATACGCCCTAAATGCAAGGTCCTACACTGGGTGGCCTCAAAGTGTCGGGACACACAC 2363
Query 2362 TATTCCTCTCAAGGTCTGTCTTTGGAGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCATTGACAAATATGGCTA 2435
||.||| |||.||||||||||||||.|||||.|||.||...||.||..||.|..||||||||||||||||
Sbjct 2364 TAATCC-----AGGCCTGTCTTTGGAGGAAATGAACAGAGGTGCCCAGTATTCAGCTGTTGACAAATATGGCTA 2432
Query 2436 TGTATCCGATCCCATGAGCTCAATGCATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTTGAGGACAGCAGC 2505
.||.||.||||||||||||.|.|||||..|.||.||..||||.||.|||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 2433 CGTGTCTGATCCCATGAGCCCGATGCACCTCCACTCCCGCCGGAACAGTGGCAGCTTTGAGGACGGCAAC 2502