Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03224
• Subject: NM_183353.3
• Aligned Length: 1872
• Identities: 1872
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAAACTCAGATTCCAATGACAAAGGAAGTGGTGATCAGTCTGCAGCACAGCGCAGAAGTCAGATGGACCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAACTCAGATTCCAATGACAAAGGAAGTGGTGATCAGTCTGCAGCACAGCGCAGAAGTCAGATGGACCG  74

Query   75  ATTGGATCGAGAAGAAGCTTTCTATCAATTTGTAAATAACCTGAGTGAAGAAGATTATAGGCTTATGAGAGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTGGATCGAGAAGAAGCTTTCTATCAATTTGTAAATAACCTGAGTGAAGAAGATTATAGGCTTATGAGAGATA  148

Query  149  ACAATTTGCTAGGCACCCCAGGTGAAAGTACTGAGGAAGAGTTGCTGAGACGACTACAGCAAATTAAAGAAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAATTTGCTAGGCACCCCAGGTGAAAGTACTGAGGAAGAGTTGCTGAGACGACTACAGCAAATTAAAGAAGGC  222

Query  223  CCACCACCGCAAAACTCAGATGAAAATAGAGGAGGAGACTCTTCAGATGATGTGTCTAATGGTGACTCTATAAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACCACCGCAAAACTCAGATGAAAATAGAGGAGGAGACTCTTCAGATGATGTGTCTAATGGTGACTCTATAAT  296

Query  297  AGACTGGCTTAACTCTGTCAGACAAACTGGAAATACAACAAGAAGTGGGCAAAGAGGAAACCAATCTTGGAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACTGGCTTAACTCTGTCAGACAAACTGGAAATACAACAAGAAGTGGGCAAAGAGGAAACCAATCTTGGAGAG  370

Query  371  CAGTGAGTCGGACTAATCCAAACAGTGGTGATTTCAGATTCAGTTTAGAGATAAATGTTAACCGTAATAATGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGAGTCGGACTAATCCAAACAGTGGTGATTTCAGATTCAGTTTAGAGATAAATGTTAACCGTAATAATGGG  444

Query  445  AGCCAAAATTCAGAGAATGAAAATGAGCCATCTGCAAGACGTTCTAGTGGAGAAAATGTGGAAAACAACAGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCAAAATTCAGAGAATGAAAATGAGCCATCTGCAAGACGTTCTAGTGGAGAAAATGTGGAAAACAACAGCCA  518

Query  519  AAGGCAAGTGGAAAACCCACGATCTGAATCAACATCTGCAAGGCCATCTAGATCAGAACGAAATTCAACTGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGCAAGTGGAAAACCCACGATCTGAATCAACATCTGCAAGGCCATCTAGATCAGAACGAAATTCAACTGAAG  592

Query  593  CGTTAACAGAGGTCCCACCTACCAGAGGTCAGAGGAGGGCAAGAAGCAGGAGCCCAGACCATCGGAGAACCAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGTTAACAGAGGTCCCACCTACCAGAGGTCAGAGGAGGGCAAGAAGCAGGAGCCCAGACCATCGGAGAACCAGA  666

Query  667  GCAAGAGCTGAAAGAAGTAGGTCACCTCTGCATCCAATGAGTGAAATTCCACGAAGATCTCATCATAGTATCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAGAGCTGAAAGAAGTAGGTCACCTCTGCATCCAATGAGTGAAATTCCACGAAGATCTCATCATAGTATCTC  740

Query  741  ATCTCAGACTTTTGAACATCCTTTGGTAAATGAGACGGAGGGAAGTTCTAGAACCCGGCACCATGTGACATTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTCAGACTTTTGAACATCCTTTGGTAAATGAGACGGAGGGAAGTTCTAGAACCCGGCACCATGTGACATTGA  814

Query  815  GGCAGCAAATATCTGGGCCTGAGTTGCTAAGTAGAGGTCTTTTTGCAGCTTCTGGAACAAGAAATGCTTCTCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCAGCAAATATCTGGGCCTGAGTTGCTAAGTAGAGGTCTTTTTGCAGCTTCTGGAACAAGAAATGCTTCTCAA  888

Query  889  GGAGCAGGTTCTTCAGACACAGCTGCCAGTGGTGAATCTACAGGATCAGGACAGAGACCTCCAACCATAGTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAGCAGGTTCTTCAGACACAGCTGCCAGTGGTGAATCTACAGGATCAGGACAGAGACCTCCAACCATAGTCCT  962

Query  963  TGATCTTCAAGTAAGAAGAGTTCGTCCTGGAGAATATCGGCAGAGAGATAGCATAGCCAGCAGAACTCGGTCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATCTTCAAGTAAGAAGAGTTCGTCCTGGAGAATATCGGCAGAGAGATAGCATAGCCAGCAGAACTCGGTCTA  1036

Query 1037  GGTCTCAGACACCAAACAACACTGTCACCTATGAAAGTGAACGAGGAGGTTTTAGGCGTACATTTTCACGTTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTCTCAGACACCAAACAACACTGTCACCTATGAAAGTGAACGAGGAGGTTTTAGGCGTACATTTTCACGTTCT  1110

Query 1111  GAGCGGGCAGGTGTGAGAACCTATGTCAGTACCATCAGAATTCCCATTCGTAGAATCTTAAATACTGGTTTAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCGGGCAGGTGTGAGAACCTATGTCAGTACCATCAGAATTCCCATTCGTAGAATCTTAAATACTGGTTTAAG  1184

Query 1185  TGAGACTACATCTGTTGCAATTCAGACCATGTTAAGGCAGATAATGACAGGTTTTGGTGAGTTAAGCTATTTTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGACTACATCTGTTGCAATTCAGACCATGTTAAGGCAGATAATGACAGGTTTTGGTGAGTTAAGCTATTTTA  1258

Query 1259  TGTACAGTGATAGCGACTCAGAGCCTACTGGCTCAGTCTCAAATCGAAATATGGAAAGGGCAGAGTCACGGAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTACAGTGATAGCGACTCAGAGCCTACTGGCTCAGTCTCAAATCGAAATATGGAAAGGGCAGAGTCACGGAGT  1332

Query 1333  GGAAGAGGAGGTTCTGGTGGTGGTAGTAGTTCTGGTTCCAGTTCGAGTTCCAGTTCCAGTTCGAGTTCCAGTTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGAAGAGGAGGTTCTGGTGGTGGTAGTAGTTCTGGTTCCAGTTCGAGTTCCAGTTCCAGTTCGAGTTCCAGTTC  1406

Query 1407  CAGTTCAAGTTCCAGTTCCAGTCCTAGTTCCAGTTCCGGTGGTGAAAGTTCAGAAACTAGCTCAGATTTATTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGTTCAAGTTCCAGTTCCAGTCCTAGTTCCAGTTCCGGTGGTGAAAGTTCAGAAACTAGCTCAGATTTATTTG  1480

Query 1481  AAGGCAGTAATGAAGGAAGCTCATCATCAGGCTCATCAGGTGCCAGGCGAGAGGGTCGACATAGGGCCCCAGTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGGCAGTAATGAAGGAAGCTCATCATCAGGCTCATCAGGTGCCAGGCGAGAGGGTCGACATAGGGCCCCAGTC  1554

Query 1555  ACATTTGATGAAAGTGGCTCTTTGCCCTTCCTTAGCCTGGCTCAGTTTTTCCTCTTAAATGAGGATGATGATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACATTTGATGAAAGTGGCTCTTTGCCCTTCCTTAGCCTGGCTCAGTTTTTCCTCTTAAATGAGGATGATGATGA  1628

Query 1629  CCAACCTAGAGGACTCACCAAAGAACAGATTGACAACTTGGCAATGAGAAGTTTTGGTGAAAATGATGCATTAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAACCTAGAGGACTCACCAAAGAACAGATTGACAACTTGGCAATGAGAAGTTTTGGTGAAAATGATGCATTAA  1702

Query 1703  AAACCTGTAGTGTTTGCATTACAGAATATACAGAAGGCAACAAACTTCGTAAACTACCTTGTTCCCATGAGTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAACCTGTAGTGTTTGCATTACAGAATATACAGAAGGCAACAAACTTCGTAAACTACCTTGTTCCCATGAGTAC  1776

Query 1777  CATGTCCACTGCATCGATCGCTGGTTATCTGAGAATTCTACCTGTCCTATTTGTCGCAGAGCAGTCTTAGCTTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATGTCCACTGCATCGATCGCTGGTTATCTGAGAATTCTACCTGTCCTATTTGTCGCAGAGCAGTCTTAGCTTC  1850

Query 1851  TGGTAACAGAGAAAGTGTTGTG  1872
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGTAACAGAGAAAGTGTTGTG  1872