Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03237
- Subject:
- NM_001276402.1
- Aligned Length:
- 1254
- Identities:
- 1000
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC 74
|||||||||||.||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGCCCCAACTTTCCGGAGGA------GGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACCGATGAGATGATCCC 68
Query 75 CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT 148
||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 69 CTTCAAGGACGAAGGCGATCCCCAGAAGGAGAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAGGGCGACT 142
Query 149 TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA 222
||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.||||
Sbjct 143 TAGCCGACATCAAGTCATCTTTGGTTAACGAGTCCGAAATCATCCCAGCCAGCAACGGGCATGAGGTGGTCAGA 216
Query 223 CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG 296
|||||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 217 CAAGCCCCGTCCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCTGATGAAGGAAAGCATCCAGACGG 290
Query 297 AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC 370
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 291 AGGCCTGTACAACAAGGGACCCTCCTACTCCAGTTACTCTGGCTACATAATGATGCCCAATATGAACAGCGACC 364
Query 371 CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC 444
|.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 365 CGTACATGTCAAATGGGTCCCTTTCTCCACCCATCCCGAGGACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCCTCT 438
Query 445 CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA 518
||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 439 CACGCGGTCCACCCGCTCACCCCCCTCATCACCTACAGCGACGAGCACTTTTCTCCGGGATCCCACCCGTCACA 512
Query 519 CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC 592
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 513 CATCCCGTCAGATGTCAACTCCAAGCAAGGCATGTCCAGACACCCTCCAGCTCCTGAAATCCCCACCTTCTACC 586
Query 593 CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG 666
||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 587 CCCTGTCTCCGGGCGGCGTTGGACAGATCACCCCACCCATTGGCT----------------------------- 631
Query 667 GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT 740
|||||||||||||||||||
Sbjct 632 -------------------------------------------------------GGTTTTCCCATCATATGAT 650
Query 741 TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC 814
|||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 651 TCCTGGTCCCCCTGGCCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAGC 724
Query 815 ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA 888
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 725 ACCCCCACACGGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAACACGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCCAAAAGA 798
Query 889 CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG 962
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 799 CCTCATATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTCATGTTATATATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTAGCTGAGTG 872
Query 963 TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG 1036
.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 873 CACGCTAAAGGAGAGTGCAGCTATCAACCAGATCCTGGGCAGAAGATGGCACGCCCTCTCCCGGGAAGAGCAGG 946
Query 1037 CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC 1110
|.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct 947 CCAAATACTATGAACTAGCACGGAAAGAGAGACAGCTACACATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCAGCGCGAGAC 1020
Query 1111 AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGTACAGGTCCAAGAATGAC 1184
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.|||||| ||| |||| ||
Sbjct 1021 AATTATGGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAGCTACAGGAGTCGACTTCAGGT---GGT--AAGA--GA- 1086
Query 1185 AGCTGCCTACATC--------------------------------------------------------- 1197
|||| ||| ||
Sbjct 1087 AGCT-CCT---TCCCAACGTGCAAAGCCAAGGCAGCGACCCCAGGCCCTCTTCTGGAGATGGAAGCTTGT 1152