Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03237
• Subject: XM_006501068.3
• Aligned Length: 1254
• Identities: 1082
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC  74
            |||||||||||.|||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCAACTTTCCGGAGGA------GGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACCGATGAGATGATCCC  68

Query   75  CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct   69  CTTCAAGGACGAAGGCGATCCCCAGAAGGAGAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAGGGCGACT  142

Query  149  TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA  222
            ||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.||||
Sbjct  143  TAGCCGACATCAAGTCATCTTTGGTTAACGAGTCCGAAATCATCCCAGCCAGCAACGGGCATGAGGTGGTCAGA  216

Query  223  CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG  296
            |||||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  217  CAAGCCCCGTCCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCTGATGAAGGAAAGCATCCAGACGG  290

Query  297  AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct  291  AGGCCTGTACAACAAGGGACCCTCCTACTCCAGTTACTCTGGCTACATAATGATGCCCAATATGAACAGCGACC  364

Query  371  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  444
            |.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  365  CGTACATGTCAAATGGGTCCCTTTCTCCACCCATCCCGAGGACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCCTCT  438

Query  445  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  518
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  439  CACGCGGTCCACCCGCTCACCCCCCTCATCACCTACAGCGACGAGCACTTTTCTCCGGGATCCCACCCGTCACA  512

Query  519  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  592
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  513  CATCCCGTCAGATGTCAACTCCAAGCAAGGCATGTCCAGACACCCTCCAGCTCCTGAAATCCCCACCTTCTACC  586

Query  593  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  666
            ||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  587  CCCTGTCTCCGGGCGGCGTTGGACAGATCACCCCACCCATTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTTTATCCCATCACG  660

Query  667  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGGCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  734

Query  741  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  814
            |||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  735  TCCTGGTCCCCCTGGCCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAGC  808

Query  815  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  888
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  809  ACCCCCACACGGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAACACGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCCAAAAGA  882

Query  889  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  962
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  883  CCTCATATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTCATGTTATATATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTAGCTGAGTG  956

Query  963  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  1036
            .||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  957  CACGCTAAAGGAGAGTGCAGCTATCAACCAGATCCTGGGCAGAAGATGGCACGCCCTCTCCCGGGAAGAGCAGG  1030

Query 1037  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  1110
            |.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct 1031  CCAAATACTATGAACTAGCACGGAAAGAGAGACAGCTACACATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCAGCGCGAGAC  1104

Query 1111  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGTACAGGTCCAAGAATGAC  1184
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||   |||  ||||  || 
Sbjct 1105  AATTATGGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAGCTACAGGAGTCGACTTCAGGT---GGT--AAGA--GA-  1170

Query 1185  AGCTGCCTACATC---------------------------------------------------------  1197
            |||| |||   ||                                                         
Sbjct 1171  AGCT-CCT---TCCCAACGTGCAAAGCCAAGGCAGCGACCCCAGGCCCTCTTCTGGAGATGGAAGCTTGT  1236