Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03237
• Subject: XM_006501069.2
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1011
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC  74
            |||||||||||.|||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCAACTTTCCGGAGGA------GGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACCGATGAGATGATCCC  68

Query   75  CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct   69  CTTCAAGGACGAAGGCGATCCCCAGAAGGAGAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAGGGCGACT  142

Query  149  TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA  222
            ||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.||||
Sbjct  143  TAGCCGACATCAAGTCATCTTTGGTTAACGAGTCCGAAATCATCCCAGCCAGCAACGGGCATGAGGTGGTCAGA  216

Query  223  CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG  296
            |||||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  217  CAAGCCCCGTCCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCTGATGAAGGAAAGCATCCAGACGG  290

Query  297  AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct  291  AGGCCTGTACAACAAGGGACCCTCCTACTCCAGTTACTCTGGCTACATAATGATGCCCAATATGAACAGCGACC  364

Query  371  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  444
            |.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  365  CGTACATGTCAAATGGGTCCCTTTCTCCACCCATCCCGAGGACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCCTCT  438

Query  445  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  518
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  439  CACGCGGTCCACCCGCTCACCCCCCTCATCACCTACAGCGACGAGCACTTTTCTCCGGGATCCCACCCGTCACA  512

Query  519  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  592
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  513  CATCCCGTCAGATGTCAACTCCAAGCAAGGCATGTCCAGACACCCTCCAGCTCCTGAAATCCCCACCTTCTACC  586

Query  593  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  666
            ||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||                             
Sbjct  587  CCCTGTCTCCGGGCGGCGTTGGACAGATCACCCCACCCATTGGCT-----------------------------  631

Query  667  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  740
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  632  -------------------------------------------------------GGTTTTCCCATCATATGAT  650

Query  741  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  814
            |||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  651  TCCTGGTCCCCCTGGCCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAGC  724

Query  815  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  888
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  725  ACCCCCACACGGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAACACGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCCAAAAGA  798

Query  889  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  962
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  799  CCTCATATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTCATGTTATATATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTAGCTGAGTG  872

Query  963  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  1036
            .||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  873  CACGCTAAAGGAGAGTGCAGCTATCAACCAGATCCTGGGCAGAAGATGGCACGCCCTCTCCCGGGAAGAGCAGG  946

Query 1037  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  1110
            |.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct  947  CCAAATACTATGAACTAGCACGGAAAGAGAGACAGCTACACATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCAGCGCGAGAC  1020

Query 1111  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGTACAGGTCCAAGAATGAC  1184
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1021  AATTATGGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAGCTACAGGAGTCGACTTCAGGTACAGGTCCCAGAATGAC  1094

Query 1185  AGCTGCCTACATC  1197
            |||||||||||||
Sbjct 1095  AGCTGCCTACATC  1107