Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03237
• Subject: XM_006501070.3
• Aligned Length: 1254
• Identities: 898
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA  222
                                                                  |.|| || |.|||||.||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGG-CA-GGGGTGGTCAGA  18

Query  223  CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG  296
            |||||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct   19  CAAGCCCCGTCCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCTGATGAAGGAAAGCATCCAGACGG  92

Query  297  AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct   93  AGGCCTGTACAACAAGGGACCCTCCTACTCCAGTTACTCTGGCTACATAATGATGCCCAATATGAACAGCGACC  166

Query  371  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  444
            |.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  167  CGTACATGTCAAATGGGTCCCTTTCTCCACCCATCCCGAGGACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCCTCT  240

Query  445  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  518
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  241  CACGCGGTCCACCCGCTCACCCCCCTCATCACCTACAGCGACGAGCACTTTTCTCCGGGATCCCACCCGTCACA  314

Query  519  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  592
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  315  CATCCCGTCAGATGTCAACTCCAAGCAAGGCATGTCCAGACACCCTCCAGCTCCTGAAATCCCCACCTTCTACC  388

Query  593  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  666
            ||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  389  CCCTGTCTCCGGGCGGCGTTGGACAGATCACCCCACCCATTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTTTATCCCATCACG  462

Query  667  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  463  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGGCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  536

Query  741  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  814
            |||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  537  TCCTGGTCCCCCTGGCCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAGC  610

Query  815  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  888
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  611  ACCCCCACACGGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAACACGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCCAAAAGA  684

Query  889  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  962
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  685  CCTCATATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTCATGTTATATATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTAGCTGAGTG  758

Query  963  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  1036
            .||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  759  CACGCTAAAGGAGAGTGCAGCTATCAACCAGATCCTGGGCAGAAGATGGCACGCCCTCTCCCGGGAAGAGCAGG  832

Query 1037  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  1110
            |.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct  833  CCAAATACTATGAACTAGCACGGAAAGAGAGACAGCTACACATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCAGCGCGAGAC  906

Query 1111  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGTACAGGTCCAAGAATGAC  1184
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||   |||  ||||  || 
Sbjct  907  AATTATGGCAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAGCTACAGGAGTCGACTTCAGGT---GGT--AAGA--GA-  972

Query 1185  AGCTGCCTACATC---------------------------------------------------------  1197
            |||| |||   ||                                                         
Sbjct  973  AGCT-CCT---TCCCAACGTGCAAAGCCAAGGCAGCGACCCCAGGCCCTCTTCTGGAGATGGAAGCTTGT  1038